More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_01250 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  100 
 
 
71 aa  139  1.9999999999999998e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  72.31 
 
 
69 aa  94.7  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  61.43 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  61.43 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  61.43 
 
 
74 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  71.64 
 
 
72 aa  91.7  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  65.67 
 
 
67 aa  91.7  3e-18  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  90.5  7e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  66.2 
 
 
74 aa  87.8  4e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  62.12 
 
 
66 aa  88.2  4e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  65.62 
 
 
65 aa  87.4  5e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  65.62 
 
 
65 aa  86.7  1e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  64.18 
 
 
67 aa  86.7  1e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  65.67 
 
 
69 aa  86.7  1e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  61.43 
 
 
70 aa  86.7  1e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 
65 aa  85.5  2e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  61.43 
 
 
83 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  60.56 
 
 
77 aa  84.3  4e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  65.08 
 
 
68 aa  84.3  5e-16  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 
67 aa  82.8  0.000000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  69.35 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 
69 aa  82  0.000000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  64.52 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  61.19 
 
 
67 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  59.15 
 
 
79 aa  80.5  0.000000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  61.76 
 
 
77 aa  80.1  0.000000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  66.13 
 
 
83 aa  79.7  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  59.7 
 
 
77 aa  79.3  0.00000000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  61.97 
 
 
77 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  60.29 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  60.29 
 
 
85 aa  79  0.00000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  61.76 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  60.61 
 
 
66 aa  78.2  0.00000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  65.08 
 
 
80 aa  78.2  0.00000000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  60.29 
 
 
84 aa  78.2  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  60.29 
 
 
83 aa  78.2  0.00000000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  63.93 
 
 
71 aa  78.2  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  56.34 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  56.34 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  56.34 
 
 
77 aa  77.8  0.00000000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  65.08 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  61.76 
 
 
78 aa  77.4  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  64.18 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  64.18 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 
67 aa  77  0.00000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  60.66 
 
 
83 aa  77  0.00000000000008  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  53.73 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  61.9 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 
69 aa  76.3  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  61.76 
 
 
78 aa  75.9  0.0000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  63.49 
 
 
77 aa  75.5  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  58.73 
 
 
64 aa  75.1  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  63.93 
 
 
80 aa  75.1  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  61.54 
 
 
76 aa  75.5  0.0000000000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 
68 aa  75.1  0.0000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  62.5 
 
 
71 aa  74.7  0.0000000000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  52.94 
 
 
89 aa  73.9  0.0000000000007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  60.66 
 
 
83 aa  73.6  0.000000000001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  61.9 
 
 
78 aa  73.6  0.000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  58.73 
 
 
64 aa  73.6  0.000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  60.32 
 
 
78 aa  72  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  60.66 
 
 
61 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  53.03 
 
 
68 aa  72  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  59.68 
 
 
67 aa  72  0.000000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  59.38 
 
 
66 aa  71.6  0.000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  52.86 
 
 
78 aa  70.9  0.000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  67.31 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  67.31 
 
 
109 aa  70.5  0.000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  53.97 
 
 
63 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  49.25 
 
 
71 aa  70.1  0.000000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  57.14 
 
 
79 aa  70.1  0.00000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  59.09 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  60 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  59.09 
 
 
66 aa  69.3  0.00000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  50.75 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  57.38 
 
 
67 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0595  ribosomal protein L29  59.32 
 
 
79 aa  67  0.00000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.275335  normal  0.978354 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  56.9 
 
 
67 aa  67  0.00000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
66 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  55 
 
 
67 aa  65.9  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  50 
 
 
79 aa  65.9  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 
67 aa  65.5  0.0000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6606  ribosomal protein L29  65.96 
 
 
82 aa  65.1  0.0000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3915  50S ribosomal protein L29  64.71 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4307  50S ribosomal protein L29  64.71 
 
 
78 aa  64.3  0.0000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.243874  normal  0.0100959 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  51.67 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  47.69 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  57.89 
 
 
68 aa  62.8  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>