23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mlab_0088 on replicon NC_008942
Organism: Methanocorpusculum labreanum Z



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 66 aa  132  1.9999999999999998e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  74.24 
 
 		 67 aa  100  4e-21  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  68.75 
 
 		 67 aa  95.9  1e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  66.15 
 
 		 67 aa  91.7  3e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  64.06 
 
 		 67 aa  90.5  6e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  52.46 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  47.46 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  59.38 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  46.97 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  45.45 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  45.45 
 
 		 71 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  45.45 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 68 aa  51.6  0.000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 64 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 74 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 71 aa  45.1  0.0003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  40.98 
 
 		 69 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 65 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>