81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1835 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  100 
 
 
68 aa  133  8e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  81.54 
 
 
68 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  76.47 
 
 
74 aa  81.3  0.000000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  60.32 
 
 
67 aa  80.5  0.000000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  73.53 
 
 
70 aa  79.7  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  55.56 
 
 
67 aa  79  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  63.24 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  42.19 
 
 
65 aa  63.5  0.0000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  39.06 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  39.06 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  39.06 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  46.03 
 
 
66 aa  54.7  0.0000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  43.33 
 
 
68 aa  53.5  0.0000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
66 aa  53.1  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  39.06 
 
 
71 aa  52.8  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  49.21 
 
 
67 aa  52.8  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  40 
 
 
64 aa  52  0.000003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
72 aa  51.6  0.000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
69 aa  50.8  0.000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
65 aa  50.8  0.000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  41.94 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
67 aa  49.3  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
66 aa  48.9  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  45 
 
 
71 aa  48.9  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
68 aa  48.9  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
67 aa  47.8  0.00006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
67 aa  47  0.00008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
63 aa  46.6  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  38.98 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 
64 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
68 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  40.68 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  43.33 
 
 
73 aa  45.4  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  45.31 
 
 
69 aa  45.4  0.0003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  38.1 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  35.48 
 
 
67 aa  44.3  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
68 aa  44.3  0.0006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
66 aa  44.3  0.0006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  48.21 
 
 
67 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  42.62 
 
 
68 aa  43.5  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  52.27 
 
 
67 aa  43.5  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
68 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  47.17 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  49.06 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  37.88 
 
 
68 aa  42  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  43.86 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  41.51 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0746  50S ribosomal protein L29P  49.06 
 
 
57 aa  40.8  0.006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
68 aa  40.8  0.007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
62 aa  40.4  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  38.71 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  36.67 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  36.67 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  39.34 
 
 
62 aa  40.4  0.007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  36.67 
 
 
71 aa  40.4  0.007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  39.62 
 
 
68 aa  40  0.01  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  40.74 
 
 
69 aa  40  0.01  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  43.33 
 
 
63 aa  40  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>