More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_1257 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 68 aa  133  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  72.31 
 
 		 67 aa  97.4  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  69.23 
 
 		 67 aa  94.4  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 		 74 aa  83.6  9e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 66 aa  82.4  0.000000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  58.21 
 
 		 68 aa  80.1  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  62.12 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  67.86 
 
 		 71 aa  79  0.00000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  61.9 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  61.9 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 70 aa  79  0.00000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  61.9 
 
 		 71 aa  78.6  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 66 aa  78.2  0.00000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  62.12 
 
 		 71 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  58.46 
 
 		 66 aa  75.5  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  60 
 
 		 70 aa  75.5  0.0000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  56.92 
 
 		 66 aa  75.1  0.0000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  55.38 
 
 		 66 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  65.45 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  65.45 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000008  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  60 
 
 		 63 aa  72  0.000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  55.22 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  55.22 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  61.02 
 
 		 63 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  61.82 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  57.89 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  61.82 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  56.9 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  59.32 
 
 		 72 aa  67.4  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 92 aa  66.2  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 79 aa  65.9  0.0000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 		 66 aa  65.9  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  49.21 
 
 		 70 aa  65.9  0.0000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  54.24 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  60.71 
 
 		 78 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  58.49 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  57.89 
 
 		 71 aa  62.8  0.000000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 65 aa  62.8  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 67 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  58.93 
 
 		 79 aa  62.8  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  49.23 
 
 		 70 aa  61.6  0.000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  64 
 
 		 78 aa  61.2  0.000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  54.39 
 
 		 84 aa  60.5  0.000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 69 aa  60.1  0.000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0331  ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000295668  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  57.14 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 65 aa  59.7  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 74 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  46.15 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  55.17 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 65 aa  59.3  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>