245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_2706 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 69 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 69 aa  134  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  69.57 
 
 		 69 aa  93.6  8e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  63.77 
 
 		 72 aa  80.1  0.000000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  59.09 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  64.18 
 
 		 71 aa  77.4  0.00000000000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 		 67 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  58.21 
 
 		 65 aa  77  0.00000000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 67 aa  76.6  0.0000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 74 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  63.33 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  58.21 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 		 66 aa  75.9  0.0000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  62.12 
 
 		 67 aa  75.9  0.0000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  58.82 
 
 		 69 aa  75.1  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  57.81 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  57.81 
 
 		 67 aa  74.3  0.0000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  56.72 
 
 		 66 aa  72.8  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 83 aa  72  0.000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  60 
 
 		 77 aa  71.2  0.000000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 65 aa  69.7  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  56.92 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  56.92 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  56.92 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  55.74 
 
 		 84 aa  68.6  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 68 aa  68.6  0.00000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 77 aa  67.8  0.00000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  60 
 
 		 80 aa  67.8  0.00000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 64 aa  66.2  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 78 aa  66.6  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  56.67 
 
 		 85 aa  66.2  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1094  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 78 aa  66.2  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0502685 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  58.46 
 
 		 74 aa  65.9  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  52.31 
 
 		 69 aa  65.9  0.0000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 88 aa  64.7  0.0000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 69 aa  64.7  0.0000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 70 aa  63.9  0.0000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  53.85 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  47.76 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  50.82 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  53.23 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  62.75 
 
 		 109 aa  62  0.000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 76 aa  62.8  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  46.97 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  50 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 71 aa  61.6  0.000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  62.75 
 
 		 109 aa  62  0.000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 77 aa  61.6  0.000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  47.76 
 
 		 71 aa  61.2  0.000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  52.17 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  50 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 64 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  55.38 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  58.82 
 
 		 89 aa  60.1  0.000000009  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  51.92 
 
 		 67 aa  60.1  0.000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  54.84 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  55 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 77 aa  59.7  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  51.85 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 78 aa  58.9  0.00000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0262  ribosomal protein L29  64.44 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  53.57 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  50 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  62.22 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  50 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  50 
 
 		 71 aa  58.2  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  51.85 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  50 
 
 		 92 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>