291 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_3987 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  100 
 
 
63 aa  123  7e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  66.67 
 
 
63 aa  78.6  0.00000000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
69 aa  76.6  0.0000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  53.97 
 
 
71 aa  75.5  0.0000000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 
69 aa  71.2  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  53.97 
 
 
71 aa  70.5  0.000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
68 aa  69.7  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  59.65 
 
 
69 aa  68.9  0.00000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
69 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
68 aa  68.2  0.00000000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
66 aa  67.8  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
66 aa  67.4  0.00000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 
69 aa  67.4  0.00000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  50.82 
 
 
83 aa  66.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  49.21 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
74 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
68 aa  64.3  0.0000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  45.76 
 
 
67 aa  64.3  0.0000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
66 aa  64.3  0.0000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 
67 aa  63.9  0.0000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
72 aa  63.9  0.0000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  46.67 
 
 
67 aa  63.2  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
68 aa  63.5  0.000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  44.44 
 
 
77 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  48.33 
 
 
92 aa  62.8  0.000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
74 aa  62.4  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 
68 aa  61.6  0.000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  47.62 
 
 
85 aa  62  0.000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
61 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
69 aa  61.6  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  49.09 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
65 aa  61.6  0.000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
83 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
69 aa  60.8  0.000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  42.86 
 
 
84 aa  60.8  0.000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  54.1 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  44.44 
 
 
68 aa  60.5  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
78 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
62 aa  60.1  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
69 aa  60.1  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  60.1  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  44.26 
 
 
80 aa  58.9  0.00000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  44.26 
 
 
83 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  43.55 
 
 
76 aa  59.3  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 
62 aa  58.9  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  50.91 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  49.21 
 
 
65 aa  58.9  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
63 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  52.63 
 
 
69 aa  58.9  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 
79 aa  58.5  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  49.09 
 
 
69 aa  58.9  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  49.09 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  44.07 
 
 
70 aa  58.2  0.00000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  44.26 
 
 
77 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  45 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  46.03 
 
 
78 aa  57.8  0.00000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  46.03 
 
 
67 aa  57.4  0.00000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
62 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
62 aa  57  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  50.85 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  46.43 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1234  50S ribosomal protein L29P  45.16 
 
 
91 aa  56.2  0.0000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521287  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  48.98 
 
 
67 aa  56.2  0.0000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  44.26 
 
 
77 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>