21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_0539 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  100 
 
 		 67 aa  136  8.999999999999999e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  78.12 
 
 		 67 aa  106  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  75 
 
 		 67 aa  100  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  64.06 
 
 		 66 aa  90.5  6e-18  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  68.75 
 
 		 67 aa  90.1  1e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  38.98 
 
 		 65 aa  57  0.00000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  44.07 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  40.68 
 
 		 71 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  40.62 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  40.62 
 
 		 71 aa  55.5  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  47.46 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  48.48 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  37.29 
 
 		 68 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 68 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  38.98 
 
 		 64 aa  45.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  42.37 
 
 		 73 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  35.09 
 
 		 74 aa  40.4  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>