More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_1566 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  100 
 
 		 68 aa  136  7.999999999999999e-32  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  60.94 
 
 		 65 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  53.85 
 
 		 65 aa  76.3  0.0000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  58.06 
 
 		 72 aa  73.6  0.0000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  55.38 
 
 		 65 aa  73.6  0.0000000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 		 69 aa  73.2  0.000000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  72.4  0.000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 71 aa  72  0.000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  51.52 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 67 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 61 aa  68.2  0.00000000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  55.38 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  67  0.00000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 71 aa  66.2  0.0000000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  66.2  0.0000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  50.77 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 67 aa  65.5  0.0000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 68 aa  65.9  0.0000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 64 aa  65.1  0.0000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 68 aa  65.5  0.0000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 69 aa  65.5  0.0000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  55 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 		 79 aa  64.3  0.0000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  63.9  0.0000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 68 aa  62.8  0.000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  56.36 
 
 		 69 aa  63.2  0.000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 66 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  48.48 
 
 		 78 aa  62.4  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  50.79 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 69 aa  62.8  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  47.69 
 
 		 77 aa  62  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  45 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  54.1 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 66 aa  60.5  0.000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  50 
 
 		 77 aa  60.5  0.000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 68 aa  60.5  0.000000008  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 88 aa  59.7  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 83 aa  59.3  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  50 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  44.44 
 
 		 80 aa  58.2  0.00000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  45.31 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  50 
 
 		 92 aa  57.8  0.00000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 65 aa  57.8  0.00000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  46.97 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 77 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2161  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00367086  normal  0.161231 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 74 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>