286 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1787 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 
68 aa  137  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  69.35 
 
 
70 aa  89.4  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  64.52 
 
 
66 aa  85.1  3e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  68.42 
 
 
68 aa  82  0.000000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 
69 aa  79  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  60.71 
 
 
66 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  60.32 
 
 
68 aa  77  0.00000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  58.93 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
68 aa  75.5  0.0000000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  58.93 
 
 
66 aa  75.5  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 
69 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  64.29 
 
 
74 aa  75.5  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  64.29 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  64.29 
 
 
66 aa  75.1  0.0000000000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 
66 aa  74.7  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 
69 aa  74.3  0.0000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  52.38 
 
 
71 aa  73.6  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  53.97 
 
 
71 aa  73.2  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  60.38 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  60.38 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  53.97 
 
 
71 aa  72.8  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  57.63 
 
 
67 aa  72.4  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  60.38 
 
 
71 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  60 
 
 
68 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 
68 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  60 
 
 
68 aa  71.6  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  63.46 
 
 
64 aa  71.6  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  65.38 
 
 
70 aa  71.2  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
69 aa  70.5  0.000000000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  57.89 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
68 aa  68.6  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  55.36 
 
 
92 aa  67  0.00000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 
69 aa  67  0.00000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  55.77 
 
 
70 aa  66.2  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  55.93 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  53.57 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  63.2  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  51.67 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
79 aa  62.4  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  45 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  44.12 
 
 
72 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  47.06 
 
 
68 aa  59.3  0.00000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  42.19 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  47.54 
 
 
67 aa  59.3  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 
62 aa  58.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  58.2  0.00000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  50.88 
 
 
76 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
61 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  47.27 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
69 aa  57.8  0.00000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  45 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  49.09 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  51.92 
 
 
68 aa  57  0.00000007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
83 aa  57.4  0.00000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  47.27 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0716  ribosomal protein L29  39.34 
 
 
62 aa  57  0.00000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.762697  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  53.57 
 
 
84 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
74 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  44.44 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
88 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 
68 aa  56.2  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  45 
 
 
78 aa  56.2  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  48.21 
 
 
83 aa  55.5  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  45 
 
 
78 aa  55.1  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  45.61 
 
 
78 aa  55.5  0.0000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  45 
 
 
66 aa  55.1  0.0000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 
74 aa  55.5  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  43.33 
 
 
79 aa  55.1  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 
78 aa  54.7  0.0000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  45 
 
 
109 aa  54.3  0.0000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
62 aa  54.3  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  43.33 
 
 
71 aa  54.3  0.0000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
77 aa  53.9  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  52.94 
 
 
83 aa  53.9  0.0000007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  45 
 
 
63 aa  53.9  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  45.45 
 
 
71 aa  53.9  0.0000008  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
63 aa  53.5  0.0000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 
69 aa  53.5  0.0000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>