41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0103 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  73.13 
 
 		 67 aa  103  9e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 68 aa  80.5  0.000000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  61.9 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  52.38 
 
 		 65 aa  70.5  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 67 aa  66.6  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 71 aa  66.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  50.79 
 
 		 71 aa  64.3  0.0000000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  52.46 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  63.49 
 
 		 70 aa  62.4  0.000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 74 aa  62.8  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 67 aa  62  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  58.73 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 64 aa  58.2  0.00000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 67 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  45.16 
 
 		 73 aa  48.9  0.00002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 69 aa  47  0.00009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 79 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  46.43 
 
 		 68 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 115 aa  45.1  0.0003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 77 aa  44.3  0.0006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  35 
 
 		 65 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  41.82 
 
 		 63 aa  41.6  0.003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  41.38 
 
 		 68 aa  42  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  40.62 
 
 		 65 aa  42  0.003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 67 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 70 aa  40.8  0.006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  37.29 
 
 		 68 aa  40.8  0.006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 71 aa  40.4  0.007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 		 64 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  40.35 
 
 		 66 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>