More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0994 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 66 aa  124  3e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  89.39 
 
 		 66 aa  115  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  89.39 
 
 		 66 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  87.88 
 
 		 66 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  80.3 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  80.3 
 
 		 66 aa  104  5e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  78.79 
 
 		 74 aa  102  2e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  72.73 
 
 		 66 aa  97.4  6e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  68.18 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  68.18 
 
 		 66 aa  89.4  2e-17  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  65.62 
 
 		 68 aa  87.8  5e-17  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  75 
 
 		 70 aa  87  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  63.49 
 
 		 71 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 68 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 71 aa  85.9  2e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  65 
 
 		 68 aa  84.3  5e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  66.13 
 
 		 69 aa  84  6e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  63.93 
 
 		 64 aa  84  7e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 68 aa  83.6  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  61.9 
 
 		 71 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  64.52 
 
 		 69 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  64.52 
 
 		 69 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  62.12 
 
 		 92 aa  81.3  0.000000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 71 aa  79.3  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 68 aa  78.2  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  62.5 
 
 		 70 aa  77.8  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 70 aa  75.9  0.0000000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  52.38 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 69 aa  73.9  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 67 aa  73.2  0.000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  54.69 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 		 67 aa  72.4  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  56.25 
 
 		 66 aa  71.6  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 72 aa  71.2  0.000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  61.67 
 
 		 65 aa  70.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 68 aa  70.1  0.000000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  55.38 
 
 		 68 aa  69.7  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 68 aa  68.9  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 64 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  52.38 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  68.2  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 79 aa  67.8  0.00000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  56.9 
 
 		 76 aa  67.8  0.00000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 74 aa  67.8  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  67.8  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 69 aa  67.4  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  53.33 
 
 		 65 aa  67  0.00000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 63 aa  66.2  0.0000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  51.61 
 
 		 63 aa  65.9  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 70 aa  65.5  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 		 61 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  47.62 
 
 		 67 aa  64.3  0.0000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000006  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  50 
 
 		 83 aa  63.5  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  56.14 
 
 		 68 aa  63.5  0.0000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>