More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0766 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
67 aa  129  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  75 
 
 
67 aa  94.7  4e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  67.74 
 
 
72 aa  86.3  1e-16  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  64.52 
 
 
67 aa  82.4  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  63.49 
 
 
69 aa  81.6  0.000000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  66.67 
 
 
65 aa  79.7  0.00000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  64.52 
 
 
69 aa  78.2  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  63.08 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  58.73 
 
 
71 aa  77  0.00000000000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  58.46 
 
 
66 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  56.72 
 
 
68 aa  76.3  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
74 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  56.06 
 
 
68 aa  73.2  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
66 aa  73.2  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  57.14 
 
 
65 aa  72.8  0.000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 
65 aa  72  0.000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  50.77 
 
 
66 aa  70.1  0.000000000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  53.12 
 
 
64 aa  68.6  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 
74 aa  68.2  0.00000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
66 aa  68.2  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  55.38 
 
 
68 aa  67.8  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 
67 aa  67.4  0.00000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 
70 aa  67  0.00000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  54.69 
 
 
64 aa  66.6  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  53.23 
 
 
69 aa  66.6  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
64 aa  65.5  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  50 
 
 
67 aa  66.2  0.0000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  52.24 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  52.24 
 
 
64 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  55.56 
 
 
68 aa  65.1  0.0000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  46.97 
 
 
69 aa  65.1  0.0000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  50.82 
 
 
69 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3636  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  decreased coverage  0.00000000000115697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0322  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000137645  decreased coverage  0.00229804 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
64 aa  64.3  0.0000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2832  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
65 aa  64.3  0.0000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000129889  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  52.38 
 
 
77 aa  63.5  0.0000000009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  53.97 
 
 
66 aa  63.5  0.000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
69 aa  63.2  0.000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
63 aa  63.2  0.000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  50.79 
 
 
77 aa  63.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  49.21 
 
 
83 aa  62.4  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3455  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  decreased coverage  0.00364799 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0335  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000122941  normal  0.019257 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2751  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000361638  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 
67 aa  62.4  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0284  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204837  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0275  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000476905  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 
69 aa  62  0.000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0356  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000200225  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  52.46 
 
 
80 aa  62.8  0.000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  62.8  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0257  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00213265  normal  0.0167068 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  45.45 
 
 
71 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  44.62 
 
 
72 aa  62  0.000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2624  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.319258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3768  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000105209  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3161  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176836  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3738  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3060  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000156067  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3486  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000914257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1932  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000362681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3796  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
64 aa  62  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  49.21 
 
 
85 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  60.8  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  47.62 
 
 
77 aa  60.8  0.000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
66 aa  60.8  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  52.46 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  60.8  0.000000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  51.61 
 
 
77 aa  60.5  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  50.79 
 
 
83 aa  60.5  0.000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  65.91 
 
 
68 aa  60.5  0.000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  55 
 
 
64 aa  60.1  0.000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  45.31 
 
 
71 aa  60.1  0.000000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  53.33 
 
 
63 aa  60.1  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  60.1  0.00000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 
63 aa  60.1  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>