287 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_3320 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  74.19 
 
 
62 aa  95.5  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  69.35 
 
 
64 aa  92.8  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  67.74 
 
 
62 aa  88.2  3e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 
62 aa  79  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 
65 aa  77.8  0.00000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
68 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 
66 aa  72.4  0.000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  58.33 
 
 
65 aa  71.6  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 
68 aa  68.9  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  53.33 
 
 
65 aa  66.2  0.0000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
74 aa  65.5  0.0000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.1  0.0000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
69 aa  63.9  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  58.06 
 
 
62 aa  63.9  0.0000000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  62  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  48.39 
 
 
63 aa  62.4  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
68 aa  61.6  0.000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  61.6  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
67 aa  61.6  0.000000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  50 
 
 
92 aa  61.2  0.000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  46.67 
 
 
71 aa  60.8  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  60.8  0.000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
69 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
61 aa  60.1  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  44.26 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
68 aa  59.3  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  46.55 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 
69 aa  58.9  0.00000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1234  50S ribosomal protein L29P  46.55 
 
 
91 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.521287  hitchhiker  0.000757473 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 
67 aa  58.2  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 
68 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  46.55 
 
 
64 aa  58.2  0.00000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  57.8  0.00000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
67 aa  57.8  0.00000005  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
69 aa  57.4  0.00000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  57.4  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  57.4  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  57  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  44.26 
 
 
63 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  56.2  0.0000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
67 aa  56.6  0.0000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
72 aa  56.2  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
68 aa  55.8  0.0000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  45.9 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
70 aa  55.8  0.0000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  46.55 
 
 
80 aa  55.8  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4018  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.186553  hitchhiker  0.00000457744 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
68 aa  56.2  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
77 aa  55.5  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  41.67 
 
 
69 aa  55.1  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  55.5  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  45 
 
 
71 aa  55.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  43.55 
 
 
63 aa  55.1  0.0000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  44.83 
 
 
83 aa  55.5  0.0000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  46.55 
 
 
76 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  45.16 
 
 
63 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  45.16 
 
 
63 aa  54.7  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
83 aa  54.7  0.0000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  41.67 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 
65 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 
69 aa  54.7  0.0000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
67 aa  54.3  0.0000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
70 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_009972  Maur_5050  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
67 aa  53.9  0.0000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0326432  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 
69 aa  53.9  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 
88 aa  53.5  0.0000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
68 aa  53.9  0.0000008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 
66 aa  53.9  0.0000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
83 aa  53.9  0.0000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  46.55 
 
 
70 aa  53.9  0.0000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
66 aa  53.5  0.0000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  41.38 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  40 
 
 
84 aa  53.1  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 
69 aa  52.8  0.000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  45.61 
 
 
69 aa  53.5  0.000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  45.16 
 
 
63 aa  53.1  0.000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
74 aa  53.5  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>