96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1268 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 		 68 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  98.53 
 
 		 71 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  98.53 
 
 		 71 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  85.29 
 
 		 71 aa  111  3e-24  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  70.31 
 
 		 65 aa  93.6  8e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 67 aa  66.2  0.0000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  42.86 
 
 		 67 aa  61.6  0.000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  44.78 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  43.75 
 
 		 67 aa  57  0.00000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  39.06 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  42.37 
 
 		 67 aa  55.1  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  45.45 
 
 		 66 aa  54.7  0.0000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 71 aa  53.9  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 71 aa  52.8  0.000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 67 aa  52.4  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 69 aa  52.8  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31613  Ribosomal protein L35, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  40 
 
 		 123 aa  51.6  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0013308 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  43.08 
 
 		 88 aa  50.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 67 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  42.42 
 
 		 68 aa  48.9  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 61 aa  48.9  0.00002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  40.68 
 
 		 67 aa  48.1  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.71 
 
 		 65 aa  47.4  0.00006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 79 aa  47  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 67 aa  47.4  0.00008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  40 
 
 		 64 aa  47  0.00008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  44.44 
 
 		 69 aa  46.6  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 67 aa  46.2  0.0001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  34.92 
 
 		 121 aa  46.2  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  46.15 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 77 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  38.46 
 
 		 66 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 		 61 aa  45.4  0.0002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  46.88 
 
 		 74 aa  45.4  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1516  ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.380444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 65 aa  45.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  42.11 
 
 		 73 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  45.31 
 
 		 70 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 66 aa  45.1  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  35.38 
 
 		 83 aa  44.7  0.0004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  40.58 
 
 		 74 aa  44.3  0.0005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  36.51 
 
 		 74 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  36.92 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 69 aa  44.3  0.0006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 64 aa  44.3  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2026  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 62 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  43.9  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  40.62 
 
 		 73 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  34.38 
 
 		 66 aa  43.9  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07490  ribosomal protein L35, putative  34.38 
 
 		 127 aa  43.5  0.001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0097389  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01228  60S ribosomal protein L35 (AFU_orthologue; AFUA_1G10510)  37.93 
 
 		 124 aa  43.5  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.685819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 68 aa  42.7  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  41.67 
 
 		 79 aa  43.5  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 66 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 67 aa  42.7  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  37.1 
 
 		 66 aa  42.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  40 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 63 aa  42.4  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  33.85 
 
 		 66 aa  41.6  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 65 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0098  50S ribosomal protein L29P  40 
 
 		 68 aa  42  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000337188  unclonable  0.000000412154 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  38.33 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  38.6 
 
 		 63 aa  41.2  0.004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  36.07 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  32.26 
 
 		 66 aa  41.2  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  37.7 
 
 		 62 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 63 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 66 aa  40.8  0.007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3897  50S ribosomal protein L29P  36.67 
 
 		 80 aa  40.4  0.007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  39.29 
 
 		 69 aa  40.4  0.007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0961  50S ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 66 aa  40.4  0.008  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00226195  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  34.43 
 
 		 68 aa  40.4  0.008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  35.48 
 
 		 69 aa  40  0.009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  35 
 
 		 77 aa  40.4  0.009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  34.92 
 
 		 69 aa  40  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 74 aa  40  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>