56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2225 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2225  ribosomal protein L29  100 
 
 
74 aa  141  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  76.47 
 
 
68 aa  105  3e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0217  ribosomal protein L29  95.71 
 
 
70 aa  103  1e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  69.23 
 
 
68 aa  89  2e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  61.9 
 
 
67 aa  84.7  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  65.08 
 
 
67 aa  81.3  0.000000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2442  50S ribosomal protein L29P  70.59 
 
 
69 aa  77.4  0.00000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.600571 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1390  50S ribosomal protein L29P  51.56 
 
 
65 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1721  ribosomal protein L29  57.81 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.000553108  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  46.88 
 
 
68 aa  58.9  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0088  50S ribosomal protein L29P  49.15 
 
 
66 aa  57.8  0.00000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.462278 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  46.88 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  46.88 
 
 
71 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  46.88 
 
 
71 aa  56.2  0.0000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0571  ribosomal protein L29  45.9 
 
 
67 aa  55.5  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.256368  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0449  ribosomal protein L29  45.76 
 
 
67 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0204289  normal  0.419722 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0539  ribosomal protein L29  45.76 
 
 
67 aa  53.5  0.0000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.101572  normal  0.759504 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  46.67 
 
 
64 aa  53.5  0.0000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  46.48 
 
 
72 aa  52.4  0.000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2246  ribosomal protein L29  40.68 
 
 
67 aa  50.8  0.000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000401657  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  43.33 
 
 
68 aa  50.4  0.000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  46.67 
 
 
71 aa  49.7  0.00002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  45 
 
 
65 aa  47  0.00008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  45 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  47.37 
 
 
73 aa  46.6  0.0001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  42.62 
 
 
74 aa  46.2  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  41.79 
 
 
77 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
65 aa  43.9  0.0008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
69 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
69 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
69 aa  43.5  0.0009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 
69 aa  43.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  43.33 
 
 
79 aa  43.1  0.001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  37.88 
 
 
68 aa  42  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
66 aa  42.7  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0746  50S ribosomal protein L29P  50.94 
 
 
57 aa  42.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  37.88 
 
 
68 aa  41.6  0.003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
64 aa  42  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  38.33 
 
 
67 aa  41.6  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0406  ribosomal protein L29  35.94 
 
 
78 aa  40.8  0.006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  35.48 
 
 
68 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  36.36 
 
 
68 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>