32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1728 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  100 
 
 
77 aa  147  4e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  77.61 
 
 
73 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  72.86 
 
 
79 aa  97.1  8e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0746  50S ribosomal protein L29P  84.21 
 
 
57 aa  92.8  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  60 
 
 
115 aa  73.2  0.000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  55.56 
 
 
84 aa  55.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  48.39 
 
 
64 aa  48.5  0.00003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 
69 aa  46.2  0.0001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1268  50S ribosomal protein L29P  46.15 
 
 
68 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.0000000000336  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  43.48 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  38.81 
 
 
67 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  43.48 
 
 
69 aa  45.4  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0173  50S ribosomal protein L29P  44.62 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000109497  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0650  50S ribosomal protein L29P  44.62 
 
 
71 aa  45.1  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.0000000328049  decreased coverage  0.0000608142 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  45.61 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0716  50S ribosomal protein L29P  44.62 
 
 
71 aa  45.1  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.006076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  48.15 
 
 
67 aa  44.7  0.0004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0103  50S ribosomal protein L29P  48.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  40 
 
 
71 aa  43.9  0.0007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  41.38 
 
 
77 aa  43.9  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  45.76 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  38.81 
 
 
74 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  45.61 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  40.68 
 
 
67 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1835  ribosomal protein L29  43.86 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  42.11 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0008  50S ribosomal protein L29P  36.67 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000000020631  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  36.23 
 
 
67 aa  40.8  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  37.7 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  42.37 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  38.98 
 
 
65 aa  40.4  0.009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>