More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_1916 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  100 
 
 		 71 aa  140  5e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  97.18 
 
 		 71 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  85.92 
 
 		 71 aa  123  9e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  81.69 
 
 		 71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  81.69 
 
 		 71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  81.69 
 
 		 71 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  78.33 
 
 		 70 aa  97.1  8e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  64.29 
 
 		 70 aa  92  2e-18  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 68 aa  90.1  9e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 68 aa  88.2  4e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  66.67 
 
 		 66 aa  87  8e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  63.49 
 
 		 66 aa  85.5  2e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  67.86 
 
 		 70 aa  85.1  3e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  61.02 
 
 		 68 aa  84  6e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  60 
 
 		 66 aa  84  7e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 74 aa  83.2  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 68 aa  82.4  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  65 
 
 		 66 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  60.32 
 
 		 66 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  61.02 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  61.02 
 
 		 69 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  63.16 
 
 		 69 aa  80.5  0.000000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  62.07 
 
 		 68 aa  80.1  0.000000000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  62.12 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 64 aa  79  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  62.3 
 
 		 92 aa  77.8  0.00000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 67 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 		 68 aa  75.1  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  62.5 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  62.5 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 67 aa  73.6  0.0000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  53.97 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  63.79 
 
 		 69 aa  72  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  52.31 
 
 		 67 aa  72  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  57.41 
 
 		 68 aa  70.5  0.000000000008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  64.71 
 
 		 68 aa  70.1  0.00000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 66 aa  69.7  0.00000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 69 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  59.62 
 
 		 68 aa  67.8  0.00000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 79 aa  67.4  0.00000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  48.48 
 
 		 69 aa  66.6  0.0000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  65.1  0.0000000003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  55.17 
 
 		 62 aa  64.7  0.0000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 72 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  52.54 
 
 		 79 aa  63.9  0.0000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 65 aa  63.2  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  53.73 
 
 		 64 aa  62  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  50 
 
 		 76 aa  62.4  0.000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 68 aa  62  0.000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 69 aa  62  0.000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  47.62 
 
 		 77 aa  60.8  0.000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 70 aa  60.1  0.000000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 78 aa  59.7  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  46.97 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  52.54 
 
 		 79 aa  60.1  0.00000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  56.6 
 
 		 62 aa  59.3  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2967  50S ribosomal protein L29P  52.63 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.115661  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  57.14 
 
 		 71 aa  58.9  0.00000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23730  LSU ribosomal protein L29P  46.27 
 
 		 77 aa  58.9  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0241795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0430  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000570253  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  56.86 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 		 63 aa  58.2  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2679  ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 109 aa  58.9  0.00000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17080  LSU ribosomal protein L29P  50.88 
 
 		 89 aa  58.5  0.00000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00253403  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  53.57 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  46.97 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  43.94 
 
 		 69 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  46.03 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  50.94 
 
 		 67 aa  57.8  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 68 aa  57  0.00000008  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>