284 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0303 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  100 
 
 
62 aa  121  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  6e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  6e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  6e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  70 
 
 
63 aa  84.3  6e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  7e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  7e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  84  7e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  83.6  8e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  71.19 
 
 
63 aa  83.6  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  69.49 
 
 
63 aa  82  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  69.49 
 
 
63 aa  81.6  0.000000000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  66.1 
 
 
63 aa  81.3  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  62.07 
 
 
63 aa  74.7  0.0000000000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 
63 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  59.02 
 
 
63 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  55.17 
 
 
66 aa  72  0.000000000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  63.79 
 
 
63 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  63.79 
 
 
63 aa  71.2  0.000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  58.62 
 
 
92 aa  70.9  0.000000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  56.67 
 
 
63 aa  70.5  0.000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  60.34 
 
 
63 aa  70.1  0.000000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
64 aa  70.1  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  55.74 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
63 aa  69.3  0.00000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
63 aa  70.1  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  55.74 
 
 
64 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  56.67 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  56.67 
 
 
63 aa  67.4  0.00000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0331  ribosomal protein L29  57.63 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000295668  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
74 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
66 aa  65.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  55.36 
 
 
68 aa  65.9  0.0000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3516  ribosomal protein L29  56.67 
 
 
63 aa  65.1  0.0000000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000165704  hitchhiker  0.00000095159 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  55.17 
 
 
71 aa  64.7  0.0000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  54.72 
 
 
70 aa  64.3  0.0000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 
66 aa  63.9  0.0000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4268  ribosomal protein L29  55.17 
 
 
63 aa  63.9  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000037065  unclonable  0.00000000000267825 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3289  50S ribosomal protein L29  55.17 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000215489  hitchhiker  0.00000182798 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2942  50S ribosomal protein L29  55.17 
 
 
64 aa  63.5  0.0000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000229225  hitchhiker  0.00000342543 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  54.72 
 
 
66 aa  63.5  0.0000000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 
68 aa  63.5  0.0000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  52.46 
 
 
64 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  53.45 
 
 
71 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  53.45 
 
 
71 aa  62.8  0.000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 
67 aa  63.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0466  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  57.14 
 
 
71 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 
66 aa  62.4  0.000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 
69 aa  62.4  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  52.63 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  52.63 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  52.63 
 
 
71 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  55.36 
 
 
66 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  46.77 
 
 
67 aa  62  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  49.18 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  61.2  0.000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0477  50S ribosomal protein L29  66.1 
 
 
63 aa  61.2  0.000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0320734  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  54.39 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
79 aa  61.2  0.000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 
66 aa  60.8  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  53.45 
 
 
67 aa  60.8  0.000000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0335  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000122941  normal  0.019257 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3455  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000252439  decreased coverage  0.00364799 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0257  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00213265  normal  0.0167068 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  51.72 
 
 
67 aa  60.5  0.000000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2751  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000361638  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0275  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.0000476905  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0356  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000200225  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0284  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.0000000204837  normal  0.0231887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2624  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.319258  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3768  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000105209  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3060  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000156067  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
68 aa  60.1  0.00000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3738  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000269759  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3486  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000914257  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1932  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000000362681  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3796  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3161  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000176836  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 
67 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0377  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  59.3  0.00000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2832  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000129889  normal  0.463435 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0322  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000137645  decreased coverage  0.00229804 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
69 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
66 aa  59.3  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3636  50S ribosomal protein L29  50 
 
 
64 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000030517  decreased coverage  0.00000000000115697 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0505  50S ribosomal protein L29  67.5 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0397339  hitchhiker  0.000000000219257 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  47.37 
 
 
70 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>