294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_2226 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  100 
 
 		 71 aa  140  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  85.92 
 
 		 71 aa  123  9e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  84.51 
 
 		 71 aa  121  3e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  87.32 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  87.32 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  87.32 
 
 		 71 aa  121  4e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  76.67 
 
 		 70 aa  94.4  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  65.08 
 
 		 68 aa  90.5  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  70 
 
 		 70 aa  89  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  73.58 
 
 		 70 aa  86.3  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 68 aa  85.5  2e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  62.07 
 
 		 68 aa  84.7  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  66.13 
 
 		 74 aa  84.3  5e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  61.67 
 
 		 66 aa  83.6  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  67.8 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  67.8 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 66 aa  82  0.000000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  56.9 
 
 		 68 aa  81.3  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 66 aa  80.9  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 64 aa  80.5  0.000000000000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 66 aa  79.3  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  67.86 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  59.68 
 
 		 66 aa  79  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  61.82 
 
 		 68 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  62.26 
 
 		 69 aa  78.6  0.00000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  62.26 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  62.26 
 
 		 69 aa  77.8  0.00000000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  65.38 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  65.38 
 
 		 68 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  65.38 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  67.31 
 
 		 69 aa  73.6  0.0000000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  52.38 
 
 		 68 aa  73.6  0.0000000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  64.29 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  64.29 
 
 		 66 aa  73.6  0.0000000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  65.38 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  63.46 
 
 		 68 aa  72.4  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  57.41 
 
 		 68 aa  72  0.000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  65.38 
 
 		 68 aa  71.2  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 67 aa  70.9  0.000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  58.93 
 
 		 67 aa  68.6  0.00000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  48.48 
 
 		 69 aa  67  0.00000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 72 aa  66.6  0.0000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  61.54 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 79 aa  66.2  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  55.88 
 
 		 64 aa  65.5  0.0000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  48.48 
 
 		 69 aa  64.3  0.0000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  51.52 
 
 		 68 aa  63.9  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  53.45 
 
 		 62 aa  62.8  0.000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 68 aa  63.5  0.000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  57.69 
 
 		 63 aa  62.4  0.000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  58.49 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  61.6  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  51.52 
 
 		 65 aa  61.6  0.000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  50.85 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6041  50S ribosomal protein L29  55.17 
 
 		 83 aa  61.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.127214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  50 
 
 		 76 aa  60.8  0.000000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20790  LSU ribosomal protein L29P  51.67 
 
 		 78 aa  60.8  0.000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.888777  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  54.55 
 
 		 69 aa  60.8  0.000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  42.86 
 
 		 69 aa  60.5  0.000000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  55.36 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  46.97 
 
 		 71 aa  60.1  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  53.45 
 
 		 88 aa  60.1  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  49.06 
 
 		 67 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  51.72 
 
 		 84 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  52.63 
 
 		 63 aa  59.3  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  50.79 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 63 aa  58.9  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 64 aa  58.9  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29660  LSU ribosomal protein L29P  52.54 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.942606  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2706  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2391  50S ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0635  ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  46.97 
 
 		 78 aa  58.2  0.00000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0696  ribosomal protein L29  50 
 
 		 83 aa  57.8  0.00000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.66436 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0294  50S ribosomal protein L29  43.94 
 
 		 69 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00154259  normal  0.0637097 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  52.83 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2651  ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 78 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  50.94 
 
 		 70 aa  57.8  0.00000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  47.46 
 
 		 66 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3135  ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 79 aa  57.4  0.00000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  49.15 
 
 		 64 aa  57.4  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>