More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0634 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 62 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  80.65 
 
 		 64 aa  103  7e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  70.97 
 
 		 62 aa  92  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0941  50S ribosomal protein L29  67.74 
 
 		 62 aa  88.2  3e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00256084  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3320  50S ribosomal protein L29  67.74 
 
 		 62 aa  88.2  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000288023 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  61.29 
 
 		 65 aa  85.1  3e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  62.9 
 
 		 62 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  63.64 
 
 		 69 aa  69.3  0.00000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  58.93 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 65 aa  67  0.00000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 68 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  66.2  0.0000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  55 
 
 		 65 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  53.23 
 
 		 63 aa  65.1  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  49.18 
 
 		 68 aa  64.7  0.0000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.5  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  50 
 
 		 64 aa  63.5  0.0000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0603  50S ribosomal protein L29P  54.39 
 
 		 69 aa  63.5  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000090381  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 69 aa  62.4  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 68 aa  62  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  62  0.000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 69 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 68 aa  61.6  0.000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 67 aa  61.2  0.000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  45.9 
 
 		 70 aa  61.2  0.000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 68 aa  60.8  0.000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 77 aa  61.2  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  55 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  47.54 
 
 		 67 aa  60.5  0.000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 92 aa  60.5  0.000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 71 aa  60.5  0.000000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 68 aa  60.1  0.000000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  48.33 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  56.36 
 
 		 68 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0709  ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 62 aa  60.1  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000196069  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 72 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  50.82 
 
 		 71 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  59.7  0.00000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0118  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000549386  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  56.6 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0118  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392079  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2452  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 67 aa  59.3  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.206737 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0130  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.72927e-62 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 68 aa  59.3  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0113  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000302541  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0112  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000225905  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0149  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000829957  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  56.6 
 
 		 71 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  50.88 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  45.76 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 70 aa  58.9  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0139  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000056255  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5187  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000115107  unclonable  8.22707e-26 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1475  50S ribosomal protein L29  48.44 
 
 		 68 aa  58.9  0.00000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.0000000000000032863  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0118  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000370217  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0114  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.02215e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0112  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 74 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000108927  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  51.72 
 
 		 74 aa  58.2  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  50.94 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 88 aa  58.5  0.00000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  50.94 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  58.9  0.00000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  51.79 
 
 		 68 aa  58.5  0.00000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 69 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  50.94 
 
 		 71 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 65 aa  58.2  0.00000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  49.15 
 
 		 85 aa  57.8  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 66 aa  58.2  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 76 aa  58.2  0.00000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 61 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  40.98 
 
 		 68 aa  57.8  0.00000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  52.83 
 
 		 71 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000006  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 69 aa  57  0.00000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  46.55 
 
 		 83 aa  57  0.00000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 63 aa  57  0.00000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1177  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 71 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.267445  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2166  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000149227  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  40.32 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 74 aa  56.2  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  56.6  0.0000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  46.67 
 
 		 67 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>