273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dde_2249 on replicon NC_007519
Organism: Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007519  Dde_2249  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 62 aa  119  9e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000185964  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0087  50S ribosomal protein L29  77.05 
 
 		 61 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0344032 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1757  50S ribosomal protein L29  65 
 
 		 61 aa  77.4  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.171638  normal  0.386752 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  55 
 
 		 67 aa  75.5  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0668  ribosomal protein L29  60.34 
 
 		 76 aa  70.1  0.000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0746889  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2766  ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 67 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000000105507  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 74 aa  64.3  0.0000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 66 aa  64.7  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 68 aa  64.3  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  64.3  0.0000000006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 66 aa  63.5  0.0000000009  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 66 aa  63.5  0.000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 66 aa  63.2  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 71 aa  63.2  0.000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2057  ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  62.8  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00051227  normal  0.0499513 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  54.55 
 
 		 64 aa  63.2  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  50 
 
 		 72 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  46.77 
 
 		 66 aa  62.8  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  53.45 
 
 		 64 aa  62.4  0.000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 67 aa  62.4  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 71 aa  62  0.000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 64 aa  59.7  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 69 aa  60.1  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5041  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 77 aa  60.1  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0723534  normal  0.108147 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 77 aa  59.3  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 88 aa  58.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 92 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  51.67 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 62 aa  58.5  0.00000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  47.46 
 
 		 85 aa  58.2  0.00000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 79 aa  58.2  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1021  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.086261  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1038  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0463053  normal  0.422839 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3427  ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 76 aa  57.4  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.93339  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1048  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 77 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1131  ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 80 aa  57.4  0.00000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 74 aa  57  0.00000008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  48.21 
 
 		 68 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 68 aa  56.6  0.0000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0459  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  56.2  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000424556  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1823  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.340193  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2269  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000389369  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2310  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 69 aa  55.5  0.0000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372663  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  48.28 
 
 		 69 aa  56.2  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 68 aa  55.8  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 68 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0939  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.122968  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 66 aa  55.5  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  43.33 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  46.55 
 
 		 77 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1313  50S ribosomal protein L29  43.86 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.668661  normal  0.21811 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 67 aa  55.8  0.0000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1121  50S ribosomal protein L29  49.12 
 
 		 70 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 67 aa  55.5  0.0000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10723  50S ribosomal protein L29  40 
 
 		 77 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.698267  normal  0.159756 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 68 aa  55.1  0.0000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  43.55 
 
 		 69 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  48.28 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  44.26 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_425  ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  55.1  0.0000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000192974  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 		 68 aa  54.7  0.0000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  54.7  0.0000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  45 
 
 		 68 aa  54.3  0.0000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000005  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 69 aa  54.7  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 69 aa  54.3  0.0000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  54.3  0.0000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0482  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 65 aa  53.9  0.0000006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.411328  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 66 aa  54.3  0.0000006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04060  LSU ribosomal protein L29P  41.38 
 
 		 83 aa  53.9  0.0000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 69 aa  53.9  0.0000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  46.67 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  38.71 
 
 		 68 aa  53.9  0.0000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  41.94 
 
 		 63 aa  53.9  0.0000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19951  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 		 70 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.527252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  41.38 
 
 		 77 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1715  50S ribosomal protein L29  47.92 
 
 		 83 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16701  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 		 70 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>