295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_1938 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_1938  50S ribosomal protein L29  100 
 
 		 68 aa  133  9e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1372  50S ribosomal protein L29  61.02 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.232248  normal  0.529222 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  59.09 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  57.81 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  59.09 
 
 		 68 aa  79.7  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1553  50S ribosomal protein L29  59.32 
 
 		 68 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5062  50S ribosomal protein L29  58.62 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.545578 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3440  50S ribosomal protein L29  62.07 
 
 		 68 aa  77.4  0.00000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.696272  normal  0.342905 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3659  50S ribosomal protein L29  59.32 
 
 		 69 aa  77  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2810  50S ribosomal protein L29  56.72 
 
 		 67 aa  77  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.902927  normal  0.445457 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2744  ribosomal protein L29  56.72 
 
 		 68 aa  76.3  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0416079  normal  0.108023 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  58.73 
 
 		 67 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 70 aa  75.5  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2303  50S ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 69 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0116105  normal  0.098127 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1964  50S ribosomal protein L29  57.58 
 
 		 74 aa  75.1  0.0000000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0409879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3176  50S ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 69 aa  74.7  0.0000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.909718 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0262  50S ribosomal protein L29  62.5 
 
 		 66 aa  74.7  0.0000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.582427  normal  0.636432 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1670  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  74.3  0.0000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0221065  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2974  50S ribosomal protein L29  57.63 
 
 		 79 aa  73.2  0.000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.997663  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1225  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1362  ribosomal protein L29  56.45 
 
 		 70 aa  73.6  0.000000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.494656  normal  0.0336021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  55.38 
 
 		 68 aa  73.2  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1188  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  73.2  0.000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.328591  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2448  ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 71 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.338512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1916  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.174298  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2170  ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 71 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.350085 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2131  ribosomal protein L29  53.12 
 
 		 71 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.579075  normal  0.483712 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2226  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 71 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0767  ribosomal protein L29  57.81 
 
 		 92 aa  72.8  0.000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.211892  normal  0.786467 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0345  ribosomal protein L29  51.56 
 
 		 71 aa  71.6  0.000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1622  50S ribosomal protein L29  56.06 
 
 		 64 aa  72  0.000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173705  normal  0.463697 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1438  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  71.2  0.000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.397663  normal  0.137292 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  62.07 
 
 		 68 aa  71.6  0.000000000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1340  50S ribosomal protein L29  56.67 
 
 		 66 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.282614  normal  0.101292 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0572  ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 70 aa  69.7  0.00000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0599  50S ribosomal protein L29  62.96 
 
 		 69 aa  68.9  0.00000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1787  50S ribosomal protein L29P  54.24 
 
 		 68 aa  69.3  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.063594  normal  0.106706 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1345  50S ribosomal protein L29  53.73 
 
 		 67 aa  67.8  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714582 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1848  50S ribosomal protein L29  56.06 
 
 		 66 aa  67.4  0.00000000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.15271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00453  50S ribosomal protein L29  54.84 
 
 		 63 aa  66.6  0.0000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.17025  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  58.33 
 
 		 64 aa  66.6  0.0000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0994  50S ribosomal protein L29  53.03 
 
 		 66 aa  66.6  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0283422 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0706  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000555374  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0674  50S ribosomal protein L29  52.73 
 
 		 66 aa  65.5  0.0000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.000000000868112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  50.79 
 
 		 69 aa  65.1  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0221  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  64.7  0.0000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000322056  unclonable  0.0000065932 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001734  LSU ribosomal protein L29p (L35e)  53.23 
 
 		 63 aa  64.3  0.0000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000790983  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0331  ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000295668  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0178  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000674798  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0239  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0204  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000392928  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3751  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000462888  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4162  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0207  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000132572  unclonable  0.0000000000150964 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0202  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000242804  hitchhiker  0.00159664 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4048  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000921137  unclonable  0.00000000000376809 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0207  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000114763  hitchhiker  0.00000000110485 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0208  50S ribosomal protein L29  53.23 
 
 		 63 aa  63.9  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000719733  unclonable  0.00000802476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0156  50S ribosomal protein L29  53.33 
 
 		 63 aa  62.8  0.000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000636656  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0192  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  62  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000996098  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4309  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000000213718  unclonable  0.0000000000409482 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0413  ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0200811  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4682  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000146545  unclonable  0.0000000112365 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0331  ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000705173  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0166  50S ribosomal protein L29  51.61 
 
 		 63 aa  61.2  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000300233  hitchhiker  0.000293635 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  53.85 
 
 		 66 aa  60.8  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2364  ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 65 aa  60.1  0.000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.649847  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3814  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000290872  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3993  ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000756359  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0067  50S ribosomal protein L29  50 
 
 		 63 aa  60.5  0.000000009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0727  ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  60.1  0.000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000905771  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  53.97 
 
 		 68 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2316  ribosomal protein L29  47.69 
 
 		 66 aa  60.1  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00000905483  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0299  50S ribosomal protein L29  47.54 
 
 		 69 aa  59.7  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  unclonable  6.39149e-29 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06330  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 63 aa  60.1  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.674769  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 		 69 aa  59.3  0.00000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0855  50S ribosomal protein L29P  45.9 
 
 		 67 aa  58.9  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000025985  hitchhiker  0.000476718 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0492  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.27234  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4741  50S ribosomal protein L29  45.16 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0297311  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1386  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000247048  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3171  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000183391  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3309  50S ribosomal protein L29  48.39 
 
 		 64 aa  58.5  0.00000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000526811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1300  50S ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 66 aa  58.5  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.000000000050767  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1737  50S ribosomal protein L29  54.24 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000140424  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  50.85 
 
 		 68 aa  58.2  0.00000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2325  50S ribosomal protein L29  47.76 
 
 		 70 aa  58.2  0.00000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000880792  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  50 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  55.93 
 
 		 65 aa  57.4  0.00000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3011  50S ribosomal protein L29  48.33 
 
 		 64 aa  57  0.00000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000000636591  normal  0.0461975 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  44.07 
 
 		 64 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0462  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.748609  hitchhiker  0.00000252348 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0634  ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000013157  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4540  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.115011 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  49.15 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5071  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000034517  normal  0.129995 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0303  ribosomal protein L29  50.94 
 
 		 62 aa  56.2  0.0000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00299137  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0845  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.318231  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08930  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0335078 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  48.28 
 
 		 77 aa  56.6  0.0000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0495  50S ribosomal protein L29  45 
 
 		 63 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000115788  normal  0.157162 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>