65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpen_0487 on replicon NC_008698
Organism: Thermofilum pendens Hrk 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008698  Tpen_0487  ribosomal protein L29  100 
 
 
84 aa  159  1e-38  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0768  50S ribosomal protein L29P  52.38 
 
 
73 aa  61.6  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0098  50S ribosomal protein L29P  48.44 
 
 
68 aa  61.2  0.000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000337188  unclonable  0.000000412154 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0946  ribosomal protein L29  52.73 
 
 
115 aa  56.2  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1728  50S ribosomal protein L29P  55.56 
 
 
77 aa  55.8  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0552  50S ribosomal protein L29P  50 
 
 
79 aa  54.3  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  47.62 
 
 
64 aa  50.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0746  50S ribosomal protein L29P  54.24 
 
 
57 aa  49.3  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2147  50S ribosomal protein L29P  44.83 
 
 
67 aa  48.1  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.018623  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5132  ribosomal protein L29  41.18 
 
 
83 aa  47  0.00009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.76527 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0314  50S ribosomal protein L29P  40.32 
 
 
77 aa  46.6  0.0001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00171364 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2026  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.63096  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1941  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1938  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 
73 aa  46.2  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0634  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 
62 aa  46.2  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000169135  hitchhiker  0.00000000334263 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1514  ribosomal protein L29  49.15 
 
 
64 aa  46.6  0.0001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  1.42468e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1563  ribosomal protein L29  46.3 
 
 
66 aa  45.4  0.0002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1277  ribosomal protein L29  42.11 
 
 
63 aa  45.4  0.0002  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  38.89 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  45.45 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4313  ribosomal protein L29  41.18 
 
 
84 aa  45.1  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.883928  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2638  50S ribosomal protein L29P  46.97 
 
 
85 aa  45.1  0.0004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.137123  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  40 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0066  50S ribosomal protein L29  42.11 
 
 
68 aa  45.1  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.09375  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1899  50S ribosomal protein L29  37.88 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.012705  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2680  50S ribosomal protein L29P  41.54 
 
 
68 aa  44.7  0.0004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19615  predicted protein  36.99 
 
 
121 aa  44.7  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2394  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 
69 aa  44.7  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000853986  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2611  50S ribosomal protein L29  40.91 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000175569  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1193  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
79 aa  43.5  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1348  ribosomal protein L29  45.45 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  38.89 
 
 
64 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01250  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.774041  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0688  50S ribosomal protein L29  45.61 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.273143  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3987  ribosomal protein L29  45.61 
 
 
63 aa  43.5  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0223  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
65 aa  43.5  0.001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000355433  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0204  50S ribosomal protein L29  43.1 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0989  ribosomal protein L29  41.38 
 
 
67 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1354  50S ribosomal protein L29  41.67 
 
 
62 aa  42.7  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.121784  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1176  ribosomal protein L29  41.82 
 
 
71 aa  42.7  0.002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00096654  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1687  50S ribosomal protein L29  37.5 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  hitchhiker  0.000000411175  hitchhiker  0.00000000390358 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0570  50S ribosomal protein L29  43.33 
 
 
78 aa  42  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2703  ribosomal protein L29  43.64 
 
 
65 aa  42  0.003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.859678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0875  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
69 aa  41.6  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00116598  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  35.71 
 
 
71 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4499  ribosomal protein L29  44.44 
 
 
77 aa  41.6  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0115  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
66 aa  41.2  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1771  ribosomal protein L29  48.28 
 
 
73 aa  41.2  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0119  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.217136  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2299  50S ribosomal protein L29P  45.61 
 
 
68 aa  41.6  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  40.98 
 
 
66 aa  41.6  0.004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0590  50S ribosomal protein L29  42.59 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0369  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2526  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1724  50S ribosomal protein L29  37.93 
 
 
68 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0295  ribosomal protein L29  43.86 
 
 
67 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0233  50S ribosomal protein L29  38.18 
 
 
67 aa  41.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0782  ribosomal protein L29  40.38 
 
 
66 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0723  ribosomal protein L29  43.86 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0202  LSU ribosomal protein L29P  36.36 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.112179  normal  0.131015 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1919  50S ribosomal protein L29  39.44 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.824706 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3750  ribosomal protein L29  37.93 
 
 
77 aa  40.4  0.008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.775863  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0293  50S ribosomal protein L29  38.6 
 
 
68 aa  40.4  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4500  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
62 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00015602  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3016  50S ribosomal protein L29  40 
 
 
68 aa  40  0.01  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.011652  hitchhiker  0.00780318 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>