572 genes were found for organism Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>   


Locus tag
Gene type
Replicon accession
From
To
Strand
Gene Length
Product
Protein accession
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Organism name
Kingdom
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CNB00010  CDS  NC_006684  638  2012  +  1375  hypothetical protein  XP_568747  normal  0.78537  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00020  CDS  NC_006684  3551  4274  +  724  expressed protein  XP_568748  normal  0.0569974  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00030  CDS  NC_006684  4868  6210  -  1343  uroporphyrinogen decarboxylase, putative  XP_568749  decreased coverage  0.000569927  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00040  CDS  NC_006684  6344  8749  +  2406  WD-repeat protein, putative  XP_568750  normal  0.0839443  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00050  CDS  NC_006684  8921  15487  -  6567  conserved hypothetical protein  XP_568751  normal  0.0248021  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00060  CDS  NC_006684  15746  17340  +  1595  conserved hypothetical protein  XP_568752  hitchhiker  0.000170379  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00070  CDS  NC_006684  18906  19542  -  637  hypothetical protein  XP_568753  hitchhiker  0.000101472  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00080  CDS  NC_006684  19759  23789  -  4031  exonuclease, putative  XP_568754  decreased coverage  0.008122  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00090  CDS  NC_006684  24009  25012  +  1004  protein-vacuolar targeting-related protein, putative  XP_568755  normal  0.165922  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00100  CDS  NC_006684  26724  28340  -  1617  expressed protein  XP_568756  hitchhiker  0.00412276  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00110  CDS  NC_006684  28742  33972  -  5231  conserved hypothetical protein  XP_568757  normal  0.108047  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00120  CDS  NC_006684  34177  36659  +  2483  heat shock transcription factor 2, putative  XP_568758  decreased coverage  0.000900604  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00130  CDS  NC_006684  37219  40500  -  3282  caspase, putative  XP_569000  normal  0.0136994  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00140  CDS  NC_006684  42260  43695  -  1436  conserved hypothetical protein  XP_568999  normal  0.180406  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00150    NC_006684  46886  47544  -  659      normal  0.0386146  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00160  CDS  NC_006684  49241  50987  +  1747  dehydrogenase, putative  XP_568997  normal  0.185592  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00170  CDS  NC_006684  52259  54169  +  1911  expressed protein  XP_568759  normal  0.0350472  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00180    NC_006684  57364  58829  +  1466      hitchhiker  0.0018262  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00190  CDS  NC_006684  59737  61311  +  1575  1-aminocyclopropane-1-carboxylate deaminase, putative  XP_568760  hitchhiker  0.000288406  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00200  CDS  NC_006684  61483  61903  -  421  pre-mRNA splicing factor, putative  XP_568761  decreased coverage  0.000299914  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00210  CDS  NC_006684  62224  64099  +  1876  serine/threonine kinase receptor associated protein, putative  XP_568762  decreased coverage  0.00228942  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00220  CDS  NC_006684  65233  67147  +  1915  fructosyl amino acid oxidase, putative  XP_568763  normal  0.113312  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00230  CDS  NC_006684  67914  70117  +  2204  expressed protein  XP_568764  decreased coverage  0.00399187  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00240  CDS  NC_006684  70355  71502  -  1148  hypothetical protein  XP_568765  hitchhiker  0.00172002  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00250  CDS  NC_006684  71726  73160  +  1435  tRNA (guanine-N7-)-methyltransferase, putative  XP_568766  normal  0.0109828  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00260  CDS  NC_006684  74295  77432  -  3138  ER to Golgi transport-related protein, putative  XP_568767  decreased coverage  0.00276078  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00270  CDS  NC_006684  77609  79104  +  1496  nuclear pore protein seh1, putative  XP_568769  decreased coverage  0.0000774214  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00290  CDS  NC_006684  79756  81237  +  1482  expressed protein  XP_568770  decreased coverage  0.0000223097  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00300  CDS  NC_006684  81692  83731  +  2040  fructose-bisphosphate aldolase, putative  XP_568771  decreased coverage  0.000000441241  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00310  CDS  NC_006684  84020  88848  +  4829  gamma DNA-directed DNA polymerase, putative  XP_568772  decreased coverage  0.00002081  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00320  CDS  NC_006684  89376  90464  +  1089  hypothetical protein  XP_568773  hitchhiker  0.000109305  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00330  CDS  NC_006684  90816  91978  -  1163  ATP synthase delta chain, mitochondrial precursor, putative  XP_568774  hitchhiker  0.000932509  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00340  CDS  NC_006684  92464  95787  +  3324  conserved hypothetical protein  XP_568775  decreased coverage  0.00258209  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00350  CDS  NC_006684  98584  98808  +  225  hypothetical protein  XP_568776  hitchhiker  0.00128979  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00360  CDS  NC_006684  100513  104899  +  4387  hypothetical protein  XP_568777  normal  0.0321355  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00370  CDS  NC_006684  105282  106617  +  1336  fatty acid beta-oxidation-related protein, putative  XP_568778  normal  0.170907  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00380  CDS  NC_006684  107157  108963  -  1807  seryl-tRNA synthetase, putative  XP_568779  normal  0.901013  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00390  CDS  NC_006684  110195  112146  +  1952  hypothetical protein  XP_568780  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00400  CDS  NC_006684  112686  115492  -  2807  conserved hypothetical protein  XP_568782  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00410  CDS  NC_006684  116255  117834  +  1580  conserved hypothetical protein  XP_568783  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00420  CDS  NC_006684  120074  121805  +  1732  dehydrogenase, putative  XP_569052  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00430  CDS  NC_006684  123282  125881  +  2600  conserved hypothetical protein  XP_569053  normal  0.972638  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00440    NC_006684  126690  129568  +  2879      normal  0.134333  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00450  CDS  NC_006684  130419  131373  -  955  conserved hypothetical protein  XP_569054  normal  0.0211998  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00460  CDS  NC_006684  131789  133212  +  1424  hypothetical protein  XP_569055  normal  0.0378896  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00470  CDS  NC_006684  133378  134062  +  685  hypothetical protein  XP_569056  normal  0.109092  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00480  CDS  NC_006684  136391  139187  -  2797  threonine-tRNA ligase, putative  XP_569057  normal  0.3781  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00490  CDS  NC_006684  139386  143399  +  4014  Pol II transcription elongation factor, putative  XP_569058  normal  0.84309  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00500  CDS  NC_006684  143621  147038  +  3418  hypothetical protein  XP_569059  normal  0.931951  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00510  CDS  NC_006684  148075  150266  -  2192  expressed protein  XP_569060  normal  0.388757  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00520  CDS  NC_006684  151427  154357  +  2931  hypothetical protein  XP_569062  normal  0.0129615  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00530  CDS  NC_006684  154420  156139  -  1720  hypothetical protein  XP_569063  normal  0.33702  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00540  CDS  NC_006684  158586  160690  +  2105  conserved hypothetical protein  XP_569064  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00550  CDS  NC_006684  161413  162120  -  708  histone H2A-1, putative  XP_569065  normal  0.331035  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00560  CDS  NC_006684  162502  163264  +  763  histone h2b, putative  XP_569066  normal  0.146511  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00570  CDS  NC_006684  164825  165649  +  825  histone H3, putative  XP_569067  normal  0.17026  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00580  CDS  NC_006684  166202  168525  +  2324  conserved hypothetical protein  XP_569068  normal  0.328391  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00590  CDS  NC_006684  168670  169360  -  691  mitochondrial genome maintenance-related protein, putative  XP_569069  normal  0.0239835  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00600  CDS  NC_006684  169470  171202  -  1733  cytoplasm protein, putative  XP_569070  normal  0.56113  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00610  CDS  NC_006684  171392  173966  +  2575  DEAD box RNA helicase, putative  XP_569071  normal  0.31511  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00620  CDS  NC_006684  174038  177831  -  3794  conserved hypothetical protein  XP_569072  normal  0.391313  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00630  CDS  NC_006684  178702  181812  -  3111  adenosylmethionine-8-amino-7-oxononanoate transaminase, putative  XP_569073  normal  0.91283  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00640  CDS  NC_006684  182465  185213  -  2749  expressed protein  XP_569074  normal  0.114879  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00650  CDS  NC_006684  185368  188530  +  3163  vacuole organization and biogenesis-related protein, putative  XP_569075  normal  0.028778  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00660  CDS  NC_006684  188661  191052  -  2392  cysteine-type endopeptidase, putative  XP_569001  normal  0.247291  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00670  CDS  NC_006684  191122  196160  -  5039  hypothetical protein  XP_569076  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00680  CDS  NC_006684  196410  196970  +  561  DNA-directed RNA polymerases i, ii, and iii 8.3 kda polypeptide, putative  XP_569077  normal  0.0591881  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00690  CDS  NC_006684  197017  198634  -  1618  conserved hypothetical protein  XP_569078  normal  0.229021  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00700  CDS  NC_006684  198880  205438  +  6559  conserved hypothetical protein  XP_569079  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00710  CDS  NC_006684  205744  208413  +  2670  hypothetical protein  XP_569080  normal  0.394725  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00720  CDS  NC_006684  208693  211851  +  3159  glycogen synthase kinase 3, putative  XP_569081  normal  0.236908  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00730  CDS  NC_006684  211975  212446  -  472  hypothetical protein  XP_569082  normal  0.0363344  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00740  CDS  NC_006684  212697  216691  +  3995  kinesin, putative  XP_569083  normal  0.0909474  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00750  CDS  NC_006684  218315  220597  -  2283  hypothetical protein  XP_569084  decreased coverage  0.00877381  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00770  CDS  NC_006684  223436  225928  +  2493  conserved hypothetical protein  XP_569085  normal  0.104071  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00780  CDS  NC_006684  226149  228150  -  2002  DNA polymerase Delta, small subunit, putative  XP_569086  normal  0.177257  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00790  CDS  NC_006684  228360  230785  +  2426  DNA strand annealing, putative  XP_569087  normal  0.182703  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00800  CDS  NC_006684  230867  232049  -  1183  mitochondrial inner membrane protein, putative  XP_569088  normal  0.195966  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00810  CDS  NC_006684  233300  234541  +  1242  hypothetical protein  XP_569089  normal  0.109834  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00820  CDS  NC_006684  234559  237545  -  2987  transcription factor, putative  XP_569090  normal  0.140572  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00830  CDS  NC_006684  237573  238730  +  1158  expressed protein  XP_569091  normal  0.023772  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00840    NC_006684  239249  240970  +  1722      normal  0.0192077  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00850  CDS  NC_006684  243159  248136  +  4978  expressed protein  XP_569092  normal  0.622601  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00860  CDS  NC_006684  248619  249986  -  1368  longevity-assurance protein, putative  XP_569093  normal  0.129119  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00870  CDS  NC_006684  250211  251312  +  1102  hypothetical protein  XP_569094  normal  0.709286  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00880  CDS  NC_006684  251362  251892  -  531  hypothetical protein  XP_569095  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00890  CDS  NC_006684  252465  253444  -  980  ER to Golgi transport-related protein, putative  XP_569096  normal  0.53443  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00900  CDS  NC_006684  253862  256566  +  2705  cysteine-tRNA ligase, putative  XP_569097  normal  0.151967  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00910  CDS  NC_006684  256674  257516  -  843  expressed protein  XP_569098  hitchhiker  0.00432858  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00920  CDS  NC_006684  257781  258951  -  1171  hypothetical protein  XP_569002  normal  0.286854  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00930  CDS  NC_006684  259242  260003  +  762  conserved hypothetical protein  XP_569099  normal  0.264395  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00940  CDS  NC_006684  262585  266177  +  3593  conserved hypothetical protein  XP_569100  normal  0.532365  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00950  CDS  NC_006684  266216  267603  -  1388  dCMP deaminase, putative  XP_569101  normal  0.41296  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00960  CDS  NC_006684  268814  271953  +  3140  expressed protein  XP_569102  normal  0.224057  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00970  CDS  NC_006684  291413  292938  -  1526  gag-pol polyprotein, putative  XP_569103  normal  0.456464  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00980  CDS  NC_006684  294430  298566  -  4137  conserved hypothetical protein  XP_569104  normal  1  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB00990  CDS  NC_006684  298849  300866  -  2018  2-oxoglutarate metabolism-related protein, putative  XP_569105  normal  0.906389  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB01000  CDS  NC_006684  301086  304024  -  2939  hypothetical protein  XP_569106  normal  0.77991  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB01010  CDS  NC_006684  305405  307128  +  1724  conserved hypothetical protein  XP_569107  normal  0.252754  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
CNB01020  CDS  NC_006684  307153  309293  -  2141  mandelate racemase/muconate lactonizing enzyme, putative  XP_569108  normal  0.629016  n/a    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota 
 
 
-
 
Page 1 of 6    << first  < prev  1  2  3  4  5  6    next >  last >>