9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00780 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB00780  DNA polymerase Delta, small subunit, putative  100 
 
 		 510 aa  1047    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.177257  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10470  DNA polymerase III (delta) subunit (Eurofung)  36.45 
 
 		 538 aa  264  3e-69  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40682  DNA polymerase delta small subunit (Hydroxyurea sensitive protein HYS2)  31.02 
 
 		 487 aa  209  1e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.642558  normal  0.422149 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26670  predicted protein  30.06 
 
 		 429 aa  191  2e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.506097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_37723  predicted protein  25.45 
 
 		 470 aa  95.5  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  28.73 
 
 		 466 aa  58.9  0.0000002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  29.37 
 
 		 481 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  27.98 
 
 		 487 aa  50.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  27.91 
 
 		 674 aa  47.8  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>