37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A1005 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  100 
 
 		 674 aa  1356    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  49.02 
 
 		 487 aa  416  1e-114  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  48.6 
 
 		 474 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  46.7 
 
 		 467 aa  398  1e-109  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  46.28 
 
 		 465 aa  395  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  43.9 
 
 		 527 aa  389  1e-106  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  47.79 
 
 		 467 aa  387  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  44.08 
 
 		 588 aa  382  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  42.04 
 
 		 517 aa  365  1e-99  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  43.72 
 
 		 640 aa  363  4e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  42 
 
 		 514 aa  360  4e-98  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  42.65 
 
 		 537 aa  359  9e-98  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  43.63 
 
 		 578 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  43.63 
 
 		 584 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  43.63 
 
 		 583 aa  357  3.9999999999999996e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  43.72 
 
 		 594 aa  357  5e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  46.17 
 
 		 471 aa  355  2e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  40.3 
 
 		 466 aa  321  1.9999999999999998e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  36.41 
 
 		 481 aa  293  9e-78  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3619  metallophosphoesterase  23.32 
 
 		 310 aa  48.1  0.0005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000151041 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0578  metallophosphoesterase  22.8 
 
 		 325 aa  47.8  0.0006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.811544  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB00780  DNA polymerase Delta, small subunit, putative  27.91 
 
 		 510 aa  47.8  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.177257  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3012  hypothetical protein  23.2 
 
 		 315 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.905594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1040  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.8  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.269036  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1081  hypothetical protein  23.37 
 
 		 309 aa  46.6  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.31705 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0391  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1275  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1268  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0758  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1108  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.129549  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1414  calcineurin-like phosphoesterase  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0884568  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1854  Ser/Thr protein phosphatase family protein  26.99 
 
 		 312 aa  45.4  0.003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0115  metallophosphoesterase  27.98 
 
 		 270 aa  45.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.155435 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5597  metallophosphoesterase  26.73 
 
 		 355 aa  45.1  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.524554 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1311  metallophosphoesterase  28.31 
 
 		 265 aa  44.7  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2308  metallophosphoesterase  27.88 
 
 		 330 aa  44.3  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1323  metallophosphoesterase  27.61 
 
 		 313 aa  44.3  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.219072 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>