22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0612 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0612  DNA-directed DNA polymerase  100 
 
 
466 aa  950    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0409  DNA polymerase II small subunit  37.21 
 
 
467 aa  322  7e-87  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.894742  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1005  DNA polymerase II small subunit  40.3 
 
 
674 aa  321  9.999999999999999e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2412  DNA polymerase II small subunit  37.55 
 
 
474 aa  318  1e-85  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0045  DNA polymerase II small subunit  37.76 
 
 
467 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0035  DNA polymerase II small subunit  36.84 
 
 
465 aa  310  5e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0003  DNA polymerase II small subunit  38.11 
 
 
588 aa  302  7.000000000000001e-81  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.626198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0004  DNA-directed DNA polymerase  37.34 
 
 
517 aa  300  5e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1933  DNA-directed DNA polymerase  38.11 
 
 
514 aa  299  6e-80  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0817  DNA-directed DNA polymerase  37.34 
 
 
527 aa  296  6e-79  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0685678  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0659  DNA polymerase II small subunit  37.24 
 
 
487 aa  291  1e-77  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.629258  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0004  DNA polymerase II small subunit  35.11 
 
 
471 aa  288  1e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1610  DNA polymerase II small subunit  36.22 
 
 
537 aa  283  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1166  DNA polymerase II small subunit  38.15 
 
 
640 aa  271  2e-71  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1212  DNA polymerase II small subunit  36.76 
 
 
594 aa  261  2e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1005  DNA polymerase II small subunit  36.93 
 
 
578 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0941  DNA polymerase II small subunit  36.93 
 
 
584 aa  261  2e-68  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1676  DNA polymerase II small subunit  36.68 
 
 
583 aa  259  8e-68  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0002  DNA polymerase II small subunit  34.92 
 
 
481 aa  247  3e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB00780  DNA polymerase Delta, small subunit, putative  28.73 
 
 
510 aa  58.9  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.177257  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1698  serine/threonine protein phosphatase family protein  32 
 
 
282 aa  47.4  0.0005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_50274  predicted protein  21.34 
 
 
574 aa  43.5  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>