16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB00550 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB00550  histone H2A-1, putative  100 
 
 		 131 aa  259  1e-68  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.331035  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_37161  predicted protein  80 
 
 		 131 aa  207  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.990123  normal  0.458805 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_73490  predicted protein  79.23 
 
 		 131 aa  205  2e-52  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0660566  normal  0.216039 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03468  Histone H2A [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:P08844]  79.49 
 
 		 132 aa  192  1e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.503847  hitchhiker  0.000000000000165024 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_12803  predicted protein  75.93 
 
 		 121 aa  173  9e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.349541 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_46020  histone H2A isoform 2  74.14 
 
 		 138 aa  173  9e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_13104  predicted protein  75 
 
 		 121 aa  171  1.9999999999999998e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.332383 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_13304  predicted protein  72.41 
 
 		 129 aa  170  6.999999999999999e-42  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.604396  normal  0.477669 
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_26802  histone H2A isoform 3b  76.64 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_34798  histone H2A isoform 3a  76.64 
 
 		 126 aa  167  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.476071  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_9318  predicted protein  62.07 
 
 		 128 aa  132  1.9999999999999998e-30  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.373768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28445  histone H2A isoform 1  55.37 
 
 		 138 aa  128  2.0000000000000002e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.320484  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119619  predicted protein  57.98 
 
 		 143 aa  127  5.0000000000000004e-29  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.505644  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04080  histone h2a variant, putative  62.14 
 
 		 138 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08039  Histone H2A.Z [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AUJ1]  55.74 
 
 		 136 aa  118  3e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.68736  normal  0.469515 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10809  putative CCAAT-box-binding transcription factor (Eurofung)  26.92 
 
 		 251 aa  40.8  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.846198 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>