24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB01010 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 396 aa  793    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05451  ubiquitin-like protein DskB, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13420)  33.7 
 
 		 440 aa  181  2.9999999999999997e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  52.78 
 
 		 361 aa  70.9  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44323  predicted protein  28.5 
 
 		 614 aa  64.3  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  39.44 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28268  predicted protein  59.52 
 
 		 456 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  41.38 
 
 		 287 aa  55.8  0.000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43564  RAD23  37.65 
 
 		 434 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  37.14 
 
 		 128 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02304  UV excision repair protein (RadW), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06040)  30.95 
 
 		 369 aa  49.7  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0290745  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  35.71 
 
 		 129 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  32.35 
 
 		 381 aa  47  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  36.21 
 
 		 128 aa  45.8  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  30.51 
 
 		 81 aa  45.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82779  nucleotide excision repair protein (ubiquitin-like protein)  31.34 
 
 		 366 aa  45.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  31.71 
 
 		 205 aa  45.4  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  39.66 
 
 		 155 aa  45.1  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  39.58 
 
 		 88 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  30.88 
 
 		 77 aa  43.5  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  31.37 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  34.92 
 
 		 406 aa  43.5  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  31.37 
 
 		 305 aa  43.1  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  31.68 
 
 		 457 aa  43.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  37.93 
 
 		 151 aa  42.7  0.01  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>