28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_49037 on replicon NC_011688
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  100 
 
 
205 aa  428  1e-119  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29162  predicted protein  48.29 
 
 
195 aa  174  8e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.200624  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  82.98 
 
 
155 aa  159  2e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  98.7 
 
 
381 aa  158  5e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  100 
 
 
128 aa  156  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  96.1 
 
 
305 aa  154  9e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  94.81 
 
 
305 aa  152  2e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  94.81 
 
 
457 aa  152  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  96.05 
 
 
129 aa  151  5e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  94.74 
 
 
381 aa  150  1e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  94.74 
 
 
150 aa  149  4e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  86.84 
 
 
128 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  97.14 
 
 
154 aa  139  3.9999999999999997e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  95.71 
 
 
151 aa  137  7e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  83.78 
 
 
360 aa  134  8e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  80.82 
 
 
287 aa  128  5.0000000000000004e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  58.67 
 
 
77 aa  99.4  3e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  57.89 
 
 
81 aa  96.3  3e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  63.16 
 
 
268 aa  95.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  57.53 
 
 
159 aa  90.9  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  53.95 
 
 
77 aa  84.3  0.000000000000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  53.57 
 
 
88 aa  68.2  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02170  conserved hypothetical protein  40.51 
 
 
327 aa  55.5  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  41.18 
 
 
361 aa  53.9  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  34.33 
 
 
406 aa  47.8  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  31.71 
 
 
396 aa  46.2  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02304  UV excision repair protein (RadW), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06040)  34.92 
 
 
369 aa  44.7  0.001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0290745  normal 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02170  hypothetical protein  33.33 
 
 
319 aa  43.9  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>