20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA07500 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  100 
 
 		 406 aa  791    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82779  nucleotide excision repair protein (ubiquitin-like protein)  33.74 
 
 		 366 aa  178  2e-43  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26154  predicted protein  32.68 
 
 		 361 aa  143  5e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0640017  normal  0.0588293 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02304  UV excision repair protein (RadW), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06040)  38.46 
 
 		 369 aa  122  1.9999999999999998e-26  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0290745  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43564  RAD23  37.56 
 
 		 434 aa  97.4  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  33.01 
 
 		 361 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  29.58 
 
 		 360 aa  53.1  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  34.33 
 
 		 128 aa  51.2  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  27.14 
 
 		 287 aa  50.4  0.00005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  32.84 
 
 		 129 aa  50.1  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 		 396 aa  48.5  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  31.33 
 
 		 205 aa  46.6  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05451  ubiquitin-like protein DskB, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13420)  29.73 
 
 		 440 aa  45.1  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  33.78 
 
 		 150 aa  44.7  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  32.84 
 
 		 151 aa  44.7  0.003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  27.27 
 
 		 154 aa  45.1  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  34.92 
 
 		 155 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  35.14 
 
 		 381 aa  43.9  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  33.78 
 
 		 305 aa  43.1  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  33.78 
 
 		 305 aa  42.7  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>