33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_32483 on replicon NC_009361
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
150 aa  306  6.999999999999999e-83  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  84.72 
 
 
151 aa  207  4e-53  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  81.33 
 
 
154 aa  205  1e-52  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  77.7 
 
 
155 aa  179  1e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  100 
 
 
381 aa  156  1e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  98.68 
 
 
457 aa  155  2e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  97.37 
 
 
305 aa  154  4e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  97.37 
 
 
305 aa  154  4e-37  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  97.37 
 
 
129 aa  153  7e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  79.79 
 
 
205 aa  151  2e-36  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  93.51 
 
 
381 aa  149  1e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  94.74 
 
 
128 aa  148  2e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  92.11 
 
 
128 aa  146  8e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  61.11 
 
 
159 aa  145  2.0000000000000003e-34  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  85.14 
 
 
360 aa  133  9e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  78.08 
 
 
287 aa  124  4.0000000000000003e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  65.79 
 
 
268 aa  96.3  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  56.58 
 
 
77 aa  92.8  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  55.26 
 
 
81 aa  89.7  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  51.32 
 
 
77 aa  79  0.00000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  55.56 
 
 
88 aa  66.6  0.00000000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02170  conserved hypothetical protein  39.24 
 
 
327 aa  53.9  0.0000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  46.43 
 
 
361 aa  52  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  52.94 
 
 
67 aa  45.4  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  30.99 
 
 
406 aa  44.3  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  55 
 
 
67 aa  43.9  0.0007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  56.41 
 
 
67 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  50 
 
 
60 aa  42.4  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05451  ubiquitin-like protein DskB, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13420)  38.33 
 
 
440 aa  42  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  52.5 
 
 
57 aa  41.2  0.004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02170  hypothetical protein  30.67 
 
 
319 aa  41.6  0.004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47962  predicted protein  33.33 
 
 
270 aa  40.8  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.581205  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  24.75 
 
 
396 aa  40.8  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>