36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27118 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  100 
 
 		 155 aa  315  1e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  77.7 
 
 		 150 aa  191  3e-48  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  75.32 
 
 		 154 aa  189  9e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  75 
 
 		 151 aa  182  1.0000000000000001e-45  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  82.98 
 
 		 205 aa  159  1e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  100 
 
 		 128 aa  155  2e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  100 
 
 		 381 aa  154  4e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  96.05 
 
 		 129 aa  151  4e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  97.37 
 
 		 305 aa  150  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  96.05 
 
 		 305 aa  150  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  96.05 
 
 		 457 aa  149  1e-35  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  94.74 
 
 		 381 aa  148  3e-35  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  55.63 
 
 		 159 aa  142  2e-33  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  86.84 
 
 		 128 aa  140  7e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  83.78 
 
 		 360 aa  132  9.999999999999999e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  80.82 
 
 		 287 aa  127  4.0000000000000003e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  59.21 
 
 		 77 aa  98.2  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  57.89 
 
 		 81 aa  94.7  4e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  63.16 
 
 		 268 aa  94.4  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  53.95 
 
 		 77 aa  84  7e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  55.56 
 
 		 88 aa  67.8  0.00000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02170  conserved hypothetical protein  40.51 
 
 		 327 aa  57.4  0.00000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  46.43 
 
 		 361 aa  53.9  0.0000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  57.14 
 
 		 50 aa  48.1  0.00004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  53.85 
 
 		 71 aa  48.1  0.00005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  51.28 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  51.28 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  51.28 
 
 		 67 aa  45.8  0.0002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  32.39 
 
 		 406 aa  45.8  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  48.89 
 
 		 57 aa  45.4  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  39.66 
 
 		 396 aa  45.1  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  40 
 
 		 60 aa  44.3  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02170  hypothetical protein  32 
 
 		 319 aa  43.9  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02304  UV excision repair protein (RadW), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06040)  34.92 
 
 		 369 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0290745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  46.34 
 
 		 49 aa  41.6  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  51.22 
 
 		 61 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>