32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85034 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  100 
 
 		 361 aa  725    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05451  ubiquitin-like protein DskB, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13420)  50.99 
 
 		 440 aa  199  5e-50  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  42.06 
 
 		 396 aa  172  7.999999999999999e-42  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44323  predicted protein  33.79 
 
 		 614 aa  84.7  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  42.03 
 
 		 360 aa  63.9  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_28268  predicted protein  32.1 
 
 		 456 aa  62  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.322619 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  44.44 
 
 		 287 aa  60.1  0.00000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  35.92 
 
 		 381 aa  58.5  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  41.18 
 
 		 128 aa  55.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  33.33 
 
 		 381 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  46.43 
 
 		 205 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  46.43 
 
 		 155 aa  54.3  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH02170  hypothetical protein  34.33 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  32.35 
 
 		 305 aa  53.9  0.000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  46.43 
 
 		 128 aa  53.9  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  32.35 
 
 		 305 aa  53.5  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  32.35 
 
 		 457 aa  53.5  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  41.18 
 
 		 150 aa  53.5  0.000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  44.64 
 
 		 151 aa  52.4  0.00001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  44.64 
 
 		 129 aa  52.8  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  44.64 
 
 		 154 aa  52  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  33.82 
 
 		 81 aa  50.8  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  46 
 
 		 88 aa  50.8  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43564  RAD23  34.09 
 
 		 434 aa  50.4  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  30.88 
 
 		 77 aa  48.9  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  35.48 
 
 		 406 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44545  predicted protein  32.04 
 
 		 460 aa  48.9  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0152893  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  38.57 
 
 		 159 aa  49.3  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01282  glutamine-rich cytoplasmic protein (Eurofung)  37.04 
 
 		 347 aa  46.6  0.0008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.271193 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82779  nucleotide excision repair protein (ubiquitin-like protein)  33.85 
 
 		 366 aa  44.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  45.45 
 
 		 268 aa  43.9  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02304  UV excision repair protein (RadW), putative (AFU_orthologue; AFUA_5G06040)  32.88 
 
 		 369 aa  43.9  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0290745  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>