26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_26775 on replicon NC_009366
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  94.74 
 
 
381 aa  716    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  98.43 
 
 
457 aa  747    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  100 
 
 
381 aa  756    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  97.37 
 
 
305 aa  593  1e-168  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  97.37 
 
 
305 aa  590  1e-167  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  100 
 
 
150 aa  155  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  96.1 
 
 
129 aa  154  2e-36  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  94.74 
 
 
205 aa  150  4e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  93.51 
 
 
128 aa  149  8e-35  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  90.91 
 
 
128 aa  147  3e-34  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  97.14 
 
 
151 aa  140  3e-32  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  97.14 
 
 
154 aa  139  7e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  94.29 
 
 
155 aa  135  9e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  85.14 
 
 
360 aa  133  6.999999999999999e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  78.08 
 
 
287 aa  124  4e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  51.49 
 
 
268 aa  110  3e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  55.84 
 
 
81 aa  93.6  5e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  56.76 
 
 
77 aa  92  1e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  56.16 
 
 
159 aa  87.4  4e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  50.65 
 
 
77 aa  78.2  0.0000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02170  conserved hypothetical protein  25.41 
 
 
327 aa  77.8  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  51.56 
 
 
88 aa  67.4  0.0000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  33.33 
 
 
361 aa  54.7  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07500  uv excision repair protein rhp23, putative  30.99 
 
 
406 aa  44.7  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.40464  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05451  ubiquitin-like protein DskB, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G13420)  35.29 
 
 
440 aa  43.5  0.006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.803618 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4227  YadA domain-containing protein  24.17 
 
 
3355 aa  42.7  0.009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.739468 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>