38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03060 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND03060  ribosomal chaperone, putative  100 
 
 		 159 aa  328  2e-89  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.473812  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04872  Putative uncharacterized proteinUBI1 ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV58]  66.23 
 
 		 154 aa  167  7e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.171083 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73842  Ubiquitin/40S ribosomal protein S27a fusion  63.51 
 
 		 151 aa  162  2.0000000000000002e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32483  Ribosomal protein S27a, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  58.67 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079306  decreased coverage  0.00789821 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27118  ubiquitin extension protein 3  55.63 
 
 		 155 aa  133  8e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_56440  predicted protein  57.14 
 
 		 381 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.143287  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49037  predicted protein  48.96 
 
 		 205 aa  95.1  3e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.227724  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22043  ubiquitin extension protein 1/2  57.89 
 
 		 128 aa  94.7  5e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26775  predicted protein  56.58 
 
 		 381 aa  90.5  8e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.246386 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03330  ubiquitin-carboxy extension protein fusion, putative  55.26 
 
 		 129 aa  89.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.507296  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_73878  predicted protein  55.26 
 
 		 305 aa  89.7  1e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02000  Polyubiquitin Fragment [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:A2RVC1]  55.26 
 
 		 305 aa  90.1  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.505537  normal  1 
 
 
-
 
NC_006680  CNK02620  ATP-dependent protein binding protein, putative  55.26 
 
 		 457 aa  89.7  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.675175  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3361  ubiquitin  50.68 
 
 		 360 aa  80.1  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183815  normal  0.0422068 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_16428  Ribosomal protein L40, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  48.68 
 
 		 128 aa  80.1  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.328088  normal  0.0552744 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4710  ubiquitin  48.65 
 
 		 287 aa  78.2  0.00000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_40601  predicted protein  46.05 
 
 		 77 aa  72.4  0.000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.684929  normal  0.192753 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_54323  ubiquitin-like protein  46.05 
 
 		 268 aa  69.3  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_34540  predicted protein  40.79 
 
 		 77 aa  68.2  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06179  hypothetical protein similar to SPBC24C6.01c (Broad)  42.11 
 
 		 81 aa  67  0.00000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.92156 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2284  30S ribosomal protein S27ae  54.17 
 
 		 49 aa  53.1  0.000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000131146  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0564  Ribosomal protein S27a  64.86 
 
 		 50 aa  51.6  0.000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04440  ribosomal chaperone, putative  42.59 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0863999  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0284  ribosomal protein S27a  55.81 
 
 		 57 aa  50.4  0.000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.473204  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1193  30S ribosomal protein S27ae  56.1 
 
 		 67 aa  50.1  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1441  30S ribosomal protein S27ae  56.1 
 
 		 67 aa  49.7  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.168869 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0654  SSU ribosomal protein S27AE  54.76 
 
 		 60 aa  48.9  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.663989  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0467  30S ribosomal protein S27ae  56.1 
 
 		 67 aa  48.5  0.00004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0534  30S ribosomal protein S27a  47.83 
 
 		 57 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85034  predicted protein  43.1 
 
 		 361 aa  47.8  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.737973  normal  0.53722 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0281  30S ribosomal protein S27ae  50 
 
 		 49 aa  48.1  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1429  30S ribosomal protein S27ae  52.38 
 
 		 71 aa  47.8  0.00007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0599  Ribosomal protein S27a  55.81 
 
 		 51 aa  46.6  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.470612  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1325  ribosomal protein S27a  43.75 
 
 		 49 aa  44.7  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2246  ribosomal protein S27a  48 
 
 		 51 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0241  ribosomal protein S27a  51.16 
 
 		 61 aa  43.9  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.834895 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2867  ribosomal protein S27a  51.16 
 
 		 62 aa  43.1  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.260163  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01010  conserved hypothetical protein  37.93 
 
 		 396 aa  40.8  0.008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.252754  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>