128 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_0379 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_0379  YceI family protein  100 
 
 		 190 aa  387  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0433  hypothetical protein  96.84 
 
 		 190 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03578  YceI like family  54.37 
 
 		 166 aa  181  4.0000000000000006e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0100  YceI family protein  50.3 
 
 		 205 aa  176  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242107  normal  0.0242247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  28.12 
 
 		 175 aa  61.6  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  23.53 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  23.53 
 
 		 171 aa  60.5  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  26.26 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  30.17 
 
 		 223 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  28.99 
 
 		 201 aa  56.6  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  29.22 
 
 		 175 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  25.14 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  29.59 
 
 		 218 aa  54.7  0.0000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  25.26 
 
 		 190 aa  54.3  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  29.73 
 
 		 181 aa  53.1  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  24.16 
 
 		 206 aa  53.1  0.000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  25.97 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  23.7 
 
 		 175 aa  53.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  26.35 
 
 		 189 aa  52.8  0.000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  26.97 
 
 		 180 aa  52  0.000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  27.39 
 
 		 183 aa  52  0.000006  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  23.49 
 
 		 183 aa  51.6  0.000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  25.41 
 
 		 201 aa  51.2  0.000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  30.33 
 
 		 187 aa  51.2  0.000009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  29.06 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  23.46 
 
 		 201 aa  50.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  26.38 
 
 		 205 aa  50.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  24.47 
 
 		 191 aa  49.7  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  24.21 
 
 		 189 aa  49.7  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  24.11 
 
 		 190 aa  49.7  0.00003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  22.03 
 
 		 200 aa  49.3  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  24.4 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  23.78 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  24.11 
 
 		 190 aa  49.3  0.00004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  28.1 
 
 		 195 aa  48.9  0.00004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  27.03 
 
 		 210 aa  48.5  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  28.45 
 
 		 198 aa  48.9  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  28.93 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  24.44 
 
 		 214 aa  48.1  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  26.11 
 
 		 212 aa  48.1  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  25.17 
 
 		 177 aa  48.1  0.00007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  22.78 
 
 		 188 aa  48.1  0.00008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.91 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  25.13 
 
 		 207 aa  47.4  0.0001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  29.17 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  22.38 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  25.22 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  23.4 
 
 		 190 aa  46.6  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  25.49 
 
 		 174 aa  46.6  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  25.96 
 
 		 192 aa  45.8  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  25 
 
 		 186 aa  46.2  0.0003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  23.21 
 
 		 213 aa  46.2  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  26.45 
 
 		 177 aa  46.2  0.0003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  24.36 
 
 		 182 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  26.67 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  23.29 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  25.85 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  23.12 
 
 		 187 aa  45.8  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  25.85 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  25.85 
 
 		 182 aa  45.8  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  25.9 
 
 		 196 aa  45.4  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  24.74 
 
 		 207 aa  45.4  0.0005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  26.12 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3153  YceI  26.2 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0885591  normal  0.570024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  27.59 
 
 		 189 aa  45.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  25 
 
 		 183 aa  45.4  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  26.92 
 
 		 182 aa  45.1  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  21.89 
 
 		 171 aa  45.1  0.0007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  25.34 
 
 		 187 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  25 
 
 		 205 aa  45.1  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  27.15 
 
 		 205 aa  44.7  0.0008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  24.7 
 
 		 192 aa  44.7  0.0008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  24.85 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  26.03 
 
 		 187 aa  44.3  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0148  YceI  28.17 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229775  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  29.91 
 
 		 195 aa  44.7  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  26.71 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  22.29 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  21.58 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  27.11 
 
 		 200 aa  44.7  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  25.41 
 
 		 201 aa  44.7  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  27.41 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  26.56 
 
 		 197 aa  43.9  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1031  hypothetical protein  23.73 
 
 		 196 aa  43.5  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.608738  normal  0.0254223 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  26.19 
 
 		 196 aa  43.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4649  YceI family protein  28.57 
 
 		 177 aa  43.5  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.270217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  21.02 
 
 		 175 aa  43.9  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  26.23 
 
 		 201 aa  43.5  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  22.62 
 
 		 213 aa  43.5  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  23.53 
 
 		 183 aa  43.5  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  25.32 
 
 		 194 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  25.15 
 
 		 183 aa  43.9  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  29.2 
 
 		 182 aa  42.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  27.48 
 
 		 211 aa  42.7  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  22.09 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0231  YceI  24.68 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0733061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0715  YceI family protein  24.68 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  27.61 
 
 		 198 aa  42.4  0.004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  23.38 
 
 		 186 aa  42.4  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  23.65 
 
 		 177 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>