104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xfasm12_0433 on replicon NC_010513
Organism: Xylella fastidiosa M12



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010513  Xfasm12_0433  hypothetical protein  100 
 
 
190 aa  390  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0379  YceI family protein  96.84 
 
 
190 aa  375  1e-103  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03578  YceI like family  53.75 
 
 
166 aa  182  2.0000000000000003e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0100  YceI family protein  49.11 
 
 
205 aa  172  3.9999999999999995e-42  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242107  normal  0.0242247 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  27.5 
 
 
175 aa  61.6  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  25.7 
 
 
201 aa  59.3  0.00000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  24.66 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  24.66 
 
 
171 aa  57.8  0.00000009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  25.14 
 
 
223 aa  57  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  24.58 
 
 
201 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  28.57 
 
 
175 aa  56.6  0.0000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01689  YceI like family  25.44 
 
 
206 aa  53.9  0.000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  28.4 
 
 
201 aa  53.5  0.000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  23.7 
 
 
175 aa  53.5  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  29.51 
 
 
187 aa  52  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  26.22 
 
 
189 aa  51.6  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  22.35 
 
 
183 aa  51.2  0.000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  28.1 
 
 
195 aa  50.4  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  27.11 
 
 
181 aa  50.1  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  23.6 
 
 
201 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  24.74 
 
 
190 aa  50.4  0.00002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  24.26 
 
 
177 aa  49.7  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3736  YceI  28.92 
 
 
218 aa  49.7  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.192641 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  22.78 
 
 
188 aa  49.7  0.00003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  24.31 
 
 
201 aa  49.3  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  23.31 
 
 
186 aa  49.3  0.00004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  25.77 
 
 
205 aa  48.9  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  25 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  27.85 
 
 
183 aa  48.9  0.00005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  29.06 
 
 
198 aa  48.5  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  27.18 
 
 
192 aa  48.1  0.00007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  22.03 
 
 
201 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  28.33 
 
 
188 aa  47.8  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1028  YceI family protein  28.93 
 
 
191 aa  47.8  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  26.59 
 
 
180 aa  47.4  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  26.67 
 
 
184 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  21.68 
 
 
182 aa  47.4  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  27.35 
 
 
196 aa  46.6  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  26.12 
 
 
183 aa  46.6  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  21.83 
 
 
174 aa  47  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  23.7 
 
 
214 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.06 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  24.57 
 
 
212 aa  47  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4058  YceI family protein  23.03 
 
 
176 aa  46.6  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.675999  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0469  hypothetical protein  23.4 
 
 
190 aa  46.2  0.0003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.189395  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1848  YceI  21.91 
 
 
200 aa  45.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.735332 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  24.69 
 
 
182 aa  46.2  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  28.93 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  26.09 
 
 
177 aa  45.8  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  25.93 
 
 
182 aa  45.4  0.0005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0443  hypothetical protein  23.4 
 
 
190 aa  45.4  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24290  hypothetical protein  25.5 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0570577  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  25.15 
 
 
189 aa  45.4  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  23.2 
 
 
207 aa  45.1  0.0006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  25.88 
 
 
189 aa  45.1  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  22.87 
 
 
191 aa  45.1  0.0007  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  23.21 
 
 
196 aa  45.1  0.0007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  24.36 
 
 
183 aa  45.1  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  24.84 
 
 
174 aa  45.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4329  YceI family protein  27.11 
 
 
200 aa  44.7  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.969804  normal  0.149474 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0564  hypothetical protein  21.86 
 
 
174 aa  44.3  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0475935  normal  0.512882 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  29.91 
 
 
195 aa  44.3  0.001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  26.47 
 
 
210 aa  44.3  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  23.21 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  23.53 
 
 
183 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2314  hypothetical protein  20.83 
 
 
171 aa  43.1  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.613001  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  21.71 
 
 
186 aa  43.9  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  25.17 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0148  YceI  30.36 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229775  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  27.01 
 
 
189 aa  43.5  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  25.17 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  25.17 
 
 
182 aa  43.1  0.002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  28.29 
 
 
205 aa  43.9  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1536  hypothetical protein  22.7 
 
 
190 aa  43.1  0.002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  25.87 
 
 
211 aa  43.1  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  29.47 
 
 
205 aa  43.1  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  26.23 
 
 
201 aa  43.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  21.05 
 
 
193 aa  43.1  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  25.64 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  23.56 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1618  hypothetical protein  27.41 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1613  hypothetical protein  26.09 
 
 
197 aa  42.7  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  22.75 
 
 
207 aa  42.7  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3499  YceI family protein  19.87 
 
 
179 aa  42.4  0.004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0890239  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  20.38 
 
 
175 aa  42.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0122  YceI family protein  21.97 
 
 
187 aa  42  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.409556  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  28.67 
 
 
198 aa  42  0.005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0705  YceI family protein  28.7 
 
 
187 aa  42  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.587119  normal  0.613914 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  27.05 
 
 
201 aa  42  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  27.27 
 
 
213 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  27.27 
 
 
213 aa  42  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  22.82 
 
 
177 aa  42  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  28.32 
 
 
182 aa  42  0.005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  24.81 
 
 
181 aa  42  0.005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  31.52 
 
 
199 aa  42  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  25.89 
 
 
184 aa  42  0.006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3297  hypothetical protein  23.86 
 
 
191 aa  41.6  0.007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.019174  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1859  YceI family protein  28.57 
 
 
192 aa  41.6  0.007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3326  YceI family protein  24.24 
 
 
190 aa  41.6  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103156 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  20 
 
 
177 aa  41.2  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>