139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03578 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03578  YceI like family  100 
 
 		 166 aa  343  7e-94  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0100  YceI family protein  58.9 
 
 		 205 aa  204  5e-52  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242107  normal  0.0242247 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0433  hypothetical protein  53.75 
 
 		 190 aa  182  1.0000000000000001e-45  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0379  YceI family protein  54.37 
 
 		 190 aa  181  3e-45  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  30.12 
 
 		 186 aa  64.3  0.0000000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  28.85 
 
 		 177 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  30.86 
 
 		 175 aa  62.4  0.000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  34.19 
 
 		 214 aa  62.4  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  29.56 
 
 		 175 aa  60.5  0.000000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  29.71 
 
 		 201 aa  58.9  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  29.14 
 
 		 201 aa  57.4  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  33.33 
 
 		 196 aa  56.2  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  29.65 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  30.59 
 
 		 201 aa  56.2  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  29.65 
 
 		 223 aa  55.8  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  29.68 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  28.39 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  29.94 
 
 		 197 aa  54.7  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  32.76 
 
 		 198 aa  54.7  0.0000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  28 
 
 		 182 aa  54.3  0.0000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  29.94 
 
 		 197 aa  54.3  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2851  YceI family protein  35.71 
 
 		 203 aa  53.9  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.344848  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  31.62 
 
 		 201 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  25.42 
 
 		 180 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  27.78 
 
 		 211 aa  53.9  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  30.14 
 
 		 201 aa  51.6  0.000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  28.57 
 
 		 184 aa  51.6  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  27.04 
 
 		 182 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  34.58 
 
 		 188 aa  51.2  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  30.38 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  33.62 
 
 		 199 aa  50.1  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  31.78 
 
 		 185 aa  50.4  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  25.43 
 
 		 205 aa  50.1  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  29.56 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  32.17 
 
 		 180 aa  49.3  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  28.07 
 
 		 183 aa  49.7  0.00002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  28.92 
 
 		 193 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  27.91 
 
 		 205 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  32.76 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  32.76 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  32.76 
 
 		 217 aa  48.9  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  29.11 
 
 		 187 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  28.4 
 
 		 182 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  32.76 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  32.76 
 
 		 199 aa  48.5  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  29.46 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  29.46 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  29.46 
 
 		 182 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  30.84 
 
 		 181 aa  48.1  0.00005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1312  YceI family protein  29.82 
 
 		 201 aa  48.1  0.00006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000260413 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1733  YceI family protein  25.48 
 
 		 177 aa  48.1  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1371  YceI family protein  26.32 
 
 		 212 aa  47.8  0.00006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.37826  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  29.09 
 
 		 187 aa  48.1  0.00006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2711  hypothetical protein  25.64 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.440921  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2768  hypothetical protein  25.64 
 
 		 171 aa  47.8  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000157098  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  31.19 
 
 		 195 aa  47.8  0.00007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  26 
 
 		 175 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  27.33 
 
 		 201 aa  47.4  0.00009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  25.93 
 
 		 216 aa  46.6  0.0001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  26.38 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  27.03 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  26.81 
 
 		 191 aa  47  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  27.19 
 
 		 199 aa  46.6  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1457  YceI family protein  31.53 
 
 		 177 aa  46.6  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.83368  normal  0.522042 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  29.41 
 
 		 171 aa  47.4  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  31.9 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1711  YceI family protein  28.97 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0148  YceI  32.77 
 
 		 188 aa  46.6  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229775  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  27.54 
 
 		 180 aa  45.8  0.0003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  29.51 
 
 		 196 aa  45.8  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  28.22 
 
 		 183 aa  45.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  27.78 
 
 		 194 aa  45.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  27.52 
 
 		 189 aa  45.1  0.0004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  26.99 
 
 		 182 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  27.5 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2913  YceI family protein  30.17 
 
 		 201 aa  44.7  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  28.22 
 
 		 183 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0081  YceI  28.32 
 
 		 188 aa  44.7  0.0006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  29.2 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  29.53 
 
 		 189 aa  44.3  0.0007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  28.03 
 
 		 182 aa  44.3  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  23.72 
 
 		 182 aa  44.3  0.0008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  28.07 
 
 		 195 aa  44.3  0.0008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  27.56 
 
 		 237 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  27.56 
 
 		 237 aa  44.3  0.0008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0687  hypothetical protein  27.54 
 
 		 234 aa  44.3  0.0009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  29.85 
 
 		 189 aa  43.5  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3803  hypothetical protein  27.2 
 
 		 186 aa  43.9  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3996  hypothetical protein  28.33 
 
 		 187 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.29888  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  26.54 
 
 		 216 aa  43.9  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  26.25 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3578  YceI family protein  29.14 
 
 		 192 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.728206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3507  hypothetical protein  28.69 
 
 		 194 aa  43.5  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.317049  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  28.44 
 
 		 181 aa  43.5  0.001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0604  YceI family protein  27.54 
 
 		 234 aa  43.9  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2178  YceI family protein  29.49 
 
 		 188 aa  43.9  0.001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  26.25 
 
 		 190 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0089  YceI family protein  31.43 
 
 		 184 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  27.93 
 
 		 189 aa  43.1  0.002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2670  YceI family protein  27.2 
 
 		 186 aa  42.7  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.415789  normal  0.822376 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>