More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0148 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0148  YceI  100 
 
 		 188 aa  374  1e-103  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229775  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1065  YceI family protein  52.94 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175308  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2323  YceI  33.54 
 
 		 199 aa  91.3  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.977653 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  34.42 
 
 		 183 aa  86.7  2e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4763  YceI family protein  32.3 
 
 		 213 aa  83.2  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0612  YceI family protein  31.61 
 
 		 205 aa  82.4  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0392069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4400  YceI family protein  29.56 
 
 		 206 aa  80.5  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.560218 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  30.85 
 
 		 205 aa  80.1  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0861  YceI family protein  30.77 
 
 		 177 aa  80.1  0.00000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47771  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  33.14 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  29.52 
 
 		 189 aa  79  0.00000000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1933  YceI family protein  32.53 
 
 		 207 aa  78.6  0.00000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.962178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  42.2 
 
 		 186 aa  78.6  0.00000000000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  33.79 
 
 		 182 aa  78.6  0.00000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  27.17 
 
 		 179 aa  77.8  0.00000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  28.3 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  34.31 
 
 		 175 aa  76.3  0.0000000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0989  YceI family protein  37.27 
 
 		 183 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.324604  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0992  YceI family protein  36.36 
 
 		 183 aa  75.5  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00460227  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  34.9 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  30.33 
 
 		 196 aa  75.1  0.0000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  35.56 
 
 		 214 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3940  YceI family protein  40.19 
 
 		 200 aa  74.7  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0411323 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  37.19 
 
 		 187 aa  74.7  0.0000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0932  YceI  36.36 
 
 		 183 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.656064  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  31.39 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3639  YceI family protein  36.52 
 
 		 182 aa  72.8  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.162528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  34.09 
 
 		 186 aa  72.8  0.000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  33.33 
 
 		 194 aa  72.4  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  29.5 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  29.5 
 
 		 213 aa  72  0.000000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  32.79 
 
 		 197 aa  71.6  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2737  YceI family protein  37.82 
 
 		 181 aa  71.2  0.000000000008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0292655  normal  0.091865 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  31.47 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3307  YceI family protein  35.65 
 
 		 182 aa  71.2  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.872006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7583  YceI-like family protein  30.99 
 
 		 202 aa  71.2  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.94246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3001  YceI family protein  35.51 
 
 		 195 aa  71.2  0.000000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000127378  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  32.79 
 
 		 197 aa  70.5  0.00000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1121  hypothetical protein  31.67 
 
 		 177 aa  70.5  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000345646  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3995  hypothetical protein  33.56 
 
 		 189 aa  70.9  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0645736  normal  0.347265 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1086  hypothetical protein  31.13 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  30.59 
 
 		 225 aa  70.1  0.00000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0780  hypothetical protein  30.43 
 
 		 196 aa  69.3  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.263048  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  30.41 
 
 		 204 aa  69.3  0.00000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  31.37 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0419  YceI family protein  32.03 
 
 		 191 aa  68.9  0.00000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.197629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  31.62 
 
 		 184 aa  68.9  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03182  signal peptide protein  34.03 
 
 		 195 aa  68.2  0.00000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.173698  normal  0.294176 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4023  YceI family protein  32.47 
 
 		 242 aa  68.2  0.00000000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.564771 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  33.91 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  31.33 
 
 		 189 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B3019  putative YceI like family protein  27.17 
 
 		 216 aa  67.4  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4589  YceI  29.45 
 
 		 186 aa  67  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000628693  normal  0.988938 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00890  hypothetical protein  31.51 
 
 		 183 aa  67.4  0.0000000001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0963  YceI family protein  28.92 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00574961 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7002  YceI family protein  26.49 
 
 		 216 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1204  YceI  30.33 
 
 		 421 aa  66.2  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0704  YceI family protein  32.21 
 
 		 193 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.203879  normal  0.494453 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0473  hypothetical protein  30.41 
 
 		 189 aa  66.6  0.0000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  1.81293e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2790  hypothetical protein  28.72 
 
 		 193 aa  66.6  0.0000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.234701  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0927  YceI family protein  28.92 
 
 		 213 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.461867  normal  0.0884018 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000194  hypothetical protein  33.04 
 
 		 176 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000000352716  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  33.85 
 
 		 187 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4487  YceI family protein  33.02 
 
 		 441 aa  65.5  0.0000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.547173 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3192  YceI family protein  29.27 
 
 		 182 aa  65.1  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0366  YceI family protein  26.59 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0110  YceI family protein  31.62 
 
 		 210 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.180246 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0067  YceI family protein  29.19 
 
 		 171 aa  64.7  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3681  YceI  28.05 
 
 		 201 aa  64.7  0.0000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.844775  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  32.43 
 
 		 180 aa  64.7  0.0000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  27.22 
 
 		 196 aa  64.3  0.0000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  29.8 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1092  YceI family protein  27.01 
 
 		 195 aa  64.3  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00011726  normal  0.0389048 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1887  YceI family protein  31.08 
 
 		 192 aa  63.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.810222  hitchhiker  0.000541612 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25500  hypothetical protein  30.46 
 
 		 181 aa  63.9  0.000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1092  YceI family protein  26.51 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.346981  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  31.18 
 
 		 212 aa  63.9  0.000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05924  hypothetical protein  31.08 
 
 		 189 aa  63.9  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3514  YceI family protein  28.57 
 
 		 285 aa  63.9  0.000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1565  YceI family protein  32.12 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1126  hypothetical protein  26.51 
 
 		 237 aa  63.9  0.000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0634937  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0523  hypothetical protein  34.51 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3509  hypothetical protein  29.88 
 
 		 198 aa  63.2  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.137598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0903  YceI family protein  27.71 
 
 		 209 aa  63.2  0.000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.150803  normal  0.443368 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1217  hypothetical protein  29.33 
 
 		 192 aa  63.2  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00000670198  normal  0.302127 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  34.55 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  32.68 
 
 		 181 aa  63.2  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05510  hypothetical protein  34.51 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3967  YceI family protein  32.2 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3889  YceI family protein  32.71 
 
 		 201 aa  63.2  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0543172  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1317  hypothetical protein  25.77 
 
 		 191 aa  63.2  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.269449  normal  0.532637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  24.31 
 
 		 182 aa  62.8  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3826  YceI  31.36 
 
 		 201 aa  62.8  0.000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4183  YceI family protein  35.92 
 
 		 192 aa  62.8  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0607  YceI family protein  31.43 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.372987 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3203  YceI family protein  25.48 
 
 		 205 aa  62.8  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.422855 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2875  hypothetical protein  27.59 
 
 		 191 aa  62.4  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.367031  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  33.06 
 
 		 195 aa  62  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  28.95 
 
 		 178 aa  62  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  34.55 
 
 		 201 aa  62  0.000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>