94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_0100 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_0100  YceI family protein  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242107  normal  0.0242247 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03578  YceI like family  58.9 
 
 		 166 aa  204  7e-52  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0379  YceI family protein  49.43 
 
 		 190 aa  178  4e-44  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0433  hypothetical protein  48.3 
 
 		 190 aa  174  7e-43  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4531  YceI family protein  28.74 
 
 		 181 aa  68.2  0.00000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.642699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0955  YceI family protein  26.02 
 
 		 186 aa  62.8  0.000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1870  YceI family protein  26.01 
 
 		 182 aa  61.2  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0076574  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4031  YceI  27.54 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.269923  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4261  YceI family protein  27.54 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.651401  normal  0.0270494 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4106  YceI family protein  27.54 
 
 		 182 aa  60.5  0.00000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3656  YceI family protein  26.86 
 
 		 180 aa  57.4  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0464334  normal  0.0393691 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4751  YceI family protein  27.06 
 
 		 182 aa  57  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1199  YceI family protein  26.86 
 
 		 183 aa  55.8  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.144393  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3294  YceI family protein  26.67 
 
 		 182 aa  55.5  0.0000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2169  YceI family protein  26.63 
 
 		 181 aa  54.7  0.0000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0621  YceI family protein  24.87 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0461  YceI-like family protein  24.87 
 
 		 213 aa  53.9  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.151619  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2458  YceI family protein  28.4 
 
 		 187 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  hitchhiker  0.00319405  normal  0.0447487 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1065  YceI family protein  27.89 
 
 		 201 aa  53.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.175308  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2815  YceI family protein  26.88 
 
 		 175 aa  53.9  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5253  YceI family protein  23.59 
 
 		 202 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.717855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3638  YceI family protein  29.82 
 
 		 214 aa  52.4  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.159017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1281  YceI family protein  26.19 
 
 		 184 aa  52.4  0.000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2451  YceI family protein  28.49 
 
 		 205 aa  52  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2933  YceI family protein  25.88 
 
 		 182 aa  51.2  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.258273 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1026  YceI family protein  24.07 
 
 		 225 aa  50.8  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8737  YceI  29.03 
 
 		 194 aa  51.2  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2880  YceI family protein  28.25 
 
 		 181 aa  51.2  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3093  YceI family protein  25.45 
 
 		 182 aa  50.8  0.00001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3331  YceI family protein  27.43 
 
 		 246 aa  50.8  0.00001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.634515  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1467  YceI family protein  25.79 
 
 		 175 aa  50.8  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000602513  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4409  YceI family protein  26.45 
 
 		 177 aa  49.3  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0009  YceI like family protein  26.74 
 
 		 216 aa  49.3  0.00004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0008  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1154  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0007  YceI like family protein  33.33 
 
 		 217 aa  48.9  0.00005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0009  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.686573  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1434  YceI like family protein  33.33 
 
 		 199 aa  48.9  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.311091  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2036  YceI family protein  29.82 
 
 		 195 aa  48.1  0.00008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460798 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2435  YceI family protein  28.06 
 
 		 188 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.832405  normal  0.0582212 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2180  YceI family protein  31.52 
 
 		 205 aa  47.8  0.0001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3757  YceI family protein  28 
 
 		 181 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0382  hypothetical protein  24.85 
 
 		 180 aa  47.8  0.0001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0621265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1519  YceI family protein  22.73 
 
 		 191 aa  48.1  0.0001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0092  YceI family protein  27.66 
 
 		 209 aa  47.4  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.441505  normal  0.027185 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2505  YceI family protein  30.72 
 
 		 179 aa  47.4  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0958427 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0878  YceI family protein  23.39 
 
 		 182 aa  47  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0008  YceI like family protein  32.38 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1513  YceI-like family protein  33.66 
 
 		 185 aa  46.6  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.137036  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1515  YceI family protein  23.67 
 
 		 202 aa  47  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.601487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3449  YceI  27.35 
 
 		 196 aa  47  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1869  YceI family protein  23.49 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.155995  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2283  YceI family protein  23.73 
 
 		 189 aa  46.2  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1988  YceI family protein  22.62 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0382  YceI family protein  23.56 
 
 		 175 aa  46.6  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.350696 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0351  YceI family protein  22.38 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3389  YceI family protein  27.14 
 
 		 193 aa  46.6  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.013479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2493  YceI family protein  22.61 
 
 		 201 aa  46.2  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1456  hypothetical protein  22.61 
 
 		 223 aa  45.8  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2796  YceI  28.57 
 
 		 189 aa  45.8  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.552984  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4605  YceI family protein  27.45 
 
 		 196 aa  46.2  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.534592  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1722  YceI family protein  24 
 
 		 183 aa  45.8  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2371  YceI family protein  25 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3066  YceI family protein  26.34 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0262369 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3257  YceI family protein  24.1 
 
 		 178 aa  45.4  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0987348  normal  0.178917 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0172  hypothetical protein  30.17 
 
 		 190 aa  45.4  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3154  YceI  25.96 
 
 		 192 aa  45.4  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0257242  normal  0.567354 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2530  YceI family protein  28.04 
 
 		 189 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4161  YceI family protein  25.56 
 
 		 211 aa  45.1  0.0007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1207  YceI family protein  30.16 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00184458  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0530  YceI family protein  26.63 
 
 		 186 aa  45.1  0.0007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.456104  normal  1 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4591  YceI family protein  25.86 
 
 		 190 aa  45.1  0.0008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2208  YceI  25.14 
 
 		 212 aa  44.7  0.0009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0100235  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2406  YceI family protein  21.74 
 
 		 201 aa  44.7  0.0009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.213502  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0148  YceI  30.71 
 
 		 188 aa  44.3  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.229775  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4627  YceI family protein  25.52 
 
 		 175 aa  44.7  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1264  YceI family protein  28.7 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.556234  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5358  YceI family protein  27.93 
 
 		 185 aa  43.9  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4425  YceI family protein  27.45 
 
 		 188 aa  43.5  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0333  YceI family protein  22.67 
 
 		 199 aa  43.1  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.192845  normal  0.888817 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2307  YceI family protein  24.73 
 
 		 204 aa  43.1  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000152609  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3043  YceI family protein  24.62 
 
 		 210 aa  42.7  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2271  YceI family protein  29.57 
 
 		 180 aa  42.4  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0676  hypothetical protein  21.64 
 
 		 174 aa  42  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0885359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1405  YceI family protein  27.07 
 
 		 201 aa  42  0.006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247492 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2233  YceI family protein  28.1 
 
 		 211 aa  42  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.466697  normal  0.0634125 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2101  YceI family protein  24.54 
 
 		 219 aa  42  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.957341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1334  YceI  21.14 
 
 		 189 aa  42  0.006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000025527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0790  signal peptide protein  24.84 
 
 		 189 aa  41.6  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.534784  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14930  hypothetical protein  29.91 
 
 		 182 aa  41.6  0.008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2685  YceI family protein  23.38 
 
 		 174 aa  41.6  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2208  YceI  21.08 
 
 		 207 aa  41.6  0.008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.690389  normal  0.024147 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4326  YceI family protein  26.97 
 
 		 187 aa  41.2  0.009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.113695  normal  0.313074 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1917  hypothetical protein  21.08 
 
 		 207 aa  41.2  0.01  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000543514  hitchhiker  0.00086053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>