61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4206 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_2433  enamidase  84.38 
 
 		 398 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4206  amidohydrolase  100 
 
 		 399 aa  800    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1671  amidohydrolase  84.42 
 
 		 398 aa  689    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446042  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0175  amidohydrolase  70.28 
 
 		 399 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4072  enamidase  69.85 
 
 		 401 aa  541  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.815996  normal  0.0735984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0850  amidohydrolase 3  69.47 
 
 		 402 aa  543  1e-153  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0661  enamidase  68.04 
 
 		 422 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4330  amidohydrolase  67.53 
 
 		 399 aa  514  1e-144  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2144  amidohydrolase  48.17 
 
 		 387 aa  356  3.9999999999999996e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  43.83 
 
 		 385 aa  286  4e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0577  amidohydrolase 3  40.98 
 
 		 392 aa  271  2e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  33.82 
 
 		 462 aa  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  36.25 
 
 		 421 aa  51.6  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  35 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  35 
 
 		 421 aa  50.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4441  Amidohydrolase 3  41.94 
 
 		 535 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  40.91 
 
 		 541 aa  48.9  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  38.46 
 
 		 1071 aa  48.1  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  28.86 
 
 		 423 aa  48.1  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  39.19 
 
 		 550 aa  47.8  0.0003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  39.19 
 
 		 550 aa  48.1  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  39.19 
 
 		 585 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  44.12 
 
 		 411 aa  47  0.0006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  35.37 
 
 		 574 aa  47  0.0006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  23.11 
 
 		 382 aa  46.6  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  37.5 
 
 		 629 aa  46.6  0.0008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.75 
 
 		 403 aa  46.2  0.001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  25.54 
 
 		 601 aa  45.8  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3848  Amidohydrolase 3  43.75 
 
 		 564 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2152  amidohydrolase 3  38.95 
 
 		 581 aa  45.1  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.288153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3412  amidohydrolase  44.44 
 
 		 405 aa  45.1  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3819  hypothetical protein  36.49 
 
 		 160 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  26.27 
 
 		 424 aa  45.1  0.002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2836  adenine deaminase  25.85 
 
 		 597 aa  45.1  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0192  Amidohydrolase 3  34.43 
 
 		 542 aa  44.7  0.003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00766802  decreased coverage  0.000327885 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  29.01 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  29.01 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  29.01 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  29.01 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2825  amidohydrolase  41.33 
 
 		 433 aa  44.7  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.886429  normal  0.061566 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  32.29 
 
 		 576 aa  44.7  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0554  allantoinase  33.67 
 
 		 453 aa  44.7  0.003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  30.77 
 
 		 392 aa  44.7  0.003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0548  allantoinase  32.65 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00467  hypothetical protein  32.65 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0026  amidohydrolase  22.04 
 
 		 432 aa  44.3  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3111  allantoinase  32.65 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.395546 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00462  allantoinase  32.65 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0585  allantoinase  32.65 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3101  allantoinase  32.65 
 
 		 453 aa  44.3  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  33.75 
 
 		 429 aa  43.9  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  24.29 
 
 		 430 aa  43.9  0.005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2667  amidohydrolase  34.18 
 
 		 343 aa  43.9  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.05 
 
 		 429 aa  43.5  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1476  putative adenine deaminase  22.13 
 
 		 568 aa  43.9  0.006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0153306  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3714  D-aminoacylase domain protein  37.5 
 
 		 486 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0656167 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1888  dihydropyrimidinase  26.7 
 
 		 459 aa  43.5  0.007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.150297  normal  0.174622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  38.03 
 
 		 625 aa  43.1  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0186  amidohydrolase-like  38.03 
 
 		 625 aa  43.1  0.008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  35.8 
 
 		 1113 aa  43.1  0.009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  28.44 
 
 		 468 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>