58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0661 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4330  amidohydrolase  99.5 
 
 
399 aa  798    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0661  enamidase  100 
 
 
422 aa  852    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0175  amidohydrolase  78.46 
 
 
399 aa  629  1e-179  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4072  enamidase  75 
 
 
401 aa  607  9.999999999999999e-173  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.815996  normal  0.0735984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0850  amidohydrolase 3  72.68 
 
 
402 aa  590  1e-167  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2433  enamidase  69.85 
 
 
398 aa  541  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670519  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4206  amidohydrolase  69.07 
 
 
399 aa  531  1e-150  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1671  amidohydrolase  68.81 
 
 
398 aa  533  1e-150  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446042  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2144  amidohydrolase  49.61 
 
 
387 aa  367  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  44.33 
 
 
385 aa  272  7e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0577  amidohydrolase 3  40.67 
 
 
392 aa  260  2e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  35.16 
 
 
423 aa  56.2  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  41.11 
 
 
576 aa  53.9  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  34.48 
 
 
423 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  32.18 
 
 
423 aa  48.9  0.0002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  37.63 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
423 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  28.57 
 
 
430 aa  48.5  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0585  dihydroorotase  34.58 
 
 
418 aa  47.4  0.0004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.331954  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  48.48 
 
 
541 aa  47.4  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  44.68 
 
 
551 aa  47  0.0006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  40 
 
 
382 aa  47  0.0007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  46.88 
 
 
564 aa  47  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  45.76 
 
 
625 aa  47  0.0007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1680  amidohydrolase  38.38 
 
 
1062 aa  47  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.345185  normal  0.0835555 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03499  amidohydrolase  34.09 
 
 
1111 aa  46.6  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  32.18 
 
 
423 aa  46.6  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0466  amidohydrolase  33.06 
 
 
1113 aa  46.2  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.83396  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3532  amidohydrolase 3  45.71 
 
 
550 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1098  amidohydrolase  30.93 
 
 
1078 aa  45.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0010  amidohydrolase  27.56 
 
 
1066 aa  45.4  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3154  amidohydrolase-like  30.85 
 
 
585 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3848  Amidohydrolase 3  42.47 
 
 
564 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1214  Amidohydrolase 3  36.36 
 
 
527 aa  45.1  0.003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  41.51 
 
 
403 aa  44.7  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0834  amidohydrolase 3  30.18 
 
 
555 aa  44.7  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.644909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0346  amidohydrolase  31.48 
 
 
416 aa  44.3  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  46.51 
 
 
400 aa  44.3  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3245  amidohydrolase 3  46.77 
 
 
569 aa  44.3  0.004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00990212 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0251  dihydroorotase, multifunctional complex type  32.71 
 
 
418 aa  43.9  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3836  putative metal-dependent hydrolase  42.86 
 
 
550 aa  43.9  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2802  hypothetical protein  44.23 
 
 
580 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.992935  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4752  hypothetical protein  24.06 
 
 
522 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2088  amidohydrolase-like  29.81 
 
 
387 aa  43.9  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1746  imidazolonepropionase  37.29 
 
 
401 aa  43.5  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  unclonable  0.00000114698  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  39.34 
 
 
423 aa  43.9  0.006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  28.23 
 
 
429 aa  43.1  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4734  Amidohydrolase 3  44.44 
 
 
547 aa  43.1  0.008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.238595  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  26.52 
 
 
468 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4778  hypothetical protein  23.81 
 
 
522 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32950  hypothetical protein  44.23 
 
 
580 aa  43.1  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000236745 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  40.38 
 
 
419 aa  43.1  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>