39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_2433 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1671  amidohydrolase  84.6 
 
 		 398 aa  682    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446042  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4206  amidohydrolase  84.38 
 
 		 399 aa  679    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2433  enamidase  100 
 
 		 398 aa  806    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670519  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0175  amidohydrolase  70.57 
 
 		 399 aa  552  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0850  amidohydrolase 3  70.98 
 
 		 402 aa  548  1e-155  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4072  enamidase  69.92 
 
 		 401 aa  543  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.815996  normal  0.0735984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4330  amidohydrolase  69.07 
 
 		 399 aa  521  1e-147  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0661  enamidase  69.59 
 
 		 422 aa  523  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2144  amidohydrolase  49.09 
 
 		 387 aa  365  1e-100  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0577  amidohydrolase 3  41.6 
 
 		 392 aa  286  5e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  44.83 
 
 		 385 aa  285  9e-76  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  23.72 
 
 		 382 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1669  S-adenosylhomocysteine deaminase  36.76 
 
 		 462 aa  49.3  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2799  adenine deaminase  23.59 
 
 		 601 aa  49.7  0.0001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.972579 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  42.42 
 
 		 541 aa  47.4  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0515  dihydroorotase, multifunctional complex type  27.46 
 
 		 429 aa  47  0.0005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2923  adenine deaminase  34.21 
 
 		 576 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  42.42 
 
 		 420 aa  46.6  0.0008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2573  amidohydrolase family protein  38.46 
 
 		 1071 aa  46.2  0.0009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.186395  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1089  dihydroorotase  26.44 
 
 		 425 aa  46.2  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  34.38 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  32.31 
 
 		 392 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  29.7 
 
 		 421 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  31.25 
 
 		 421 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1045  dihydroorotase  28.09 
 
 		 430 aa  45.1  0.002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.197397  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33640  amidohydrolase, imidazolonepropionase  43.75 
 
 		 403 aa  45.1  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5470  Amidohydrolase 3  37.29 
 
 		 629 aa  45.4  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.660952  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1783  dihydroorotase  25.79 
 
 		 468 aa  45.1  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1160  dihydroorotase  28.5 
 
 		 423 aa  45.1  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.94631  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  29.7 
 
 		 421 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2304  Hydroxydechloroatrazine ethylaminohydrolase  33.33 
 
 		 459 aa  43.9  0.005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000537223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  24.3 
 
 		 424 aa  43.5  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  26.59 
 
 		 402 aa  43.5  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS03085  signal peptide protein  35 
 
 		 574 aa  43.5  0.007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.347904 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0268  amidohydrolase  30.91 
 
 		 451 aa  43.1  0.009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.863034  normal  0.27554 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0032  amidohydrolase  39.13 
 
 		 460 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3686  phosphonate metabolism protein PhnM  36.36 
 
 		 387 aa  43.1  0.009  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  28.17 
 
 		 455 aa  42.7  0.01  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4500  amidohydrolase  34.67 
 
 		 429 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.675979  normal  0.81819 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>