33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_0850 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012791  Vapar_0175  amidohydrolase  80.81 
 
 
399 aa  655    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4072  enamidase  82.65 
 
 
401 aa  655    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.815996  normal  0.0735984 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0850  amidohydrolase 3  100 
 
 
402 aa  808    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4330  amidohydrolase  70.93 
 
 
399 aa  581  1.0000000000000001e-165  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0661  enamidase  71.43 
 
 
422 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2433  enamidase  70.98 
 
 
398 aa  553  1e-156  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670519  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4206  amidohydrolase  70 
 
 
399 aa  548  1e-155  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1671  amidohydrolase  69.13 
 
 
398 aa  546  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446042  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2144  amidohydrolase  48.56 
 
 
387 aa  375  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  43.5 
 
 
385 aa  273  3e-72  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0577  amidohydrolase 3  39.48 
 
 
392 aa  259  8e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  31.11 
 
 
423 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2239  S-adenosylhomocysteine deaminase  28.95 
 
 
392 aa  45.8  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.975396 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0702  chlorohydrolase family protein  25.28 
 
 
455 aa  45.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  33.72 
 
 
423 aa  45.1  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  32.56 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  32.56 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  32.56 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  32.56 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  32.56 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  32.56 
 
 
423 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  40.91 
 
 
541 aa  43.5  0.006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  40.43 
 
 
551 aa  43.5  0.007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  34.69 
 
 
382 aa  43.5  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  27.19 
 
 
476 aa  43.1  0.008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0597256 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  34 
 
 
428 aa  43.1  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1532  putative exported amidohydrolase  33.77 
 
 
462 aa  43.1  0.009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.241269  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0571  allantoinase  26.87 
 
 
453 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.918572 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0569  allantoinase  26.87 
 
 
453 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0630  allantoinase  26.87 
 
 
453 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0576  allantoinase  26.87 
 
 
453 aa  43.1  0.009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.967927  normal  0.993989 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  40.3 
 
 
345 aa  43.1  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  31.4 
 
 
423 aa  43.1  0.009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>