32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0175 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0175  amidohydrolase  100 
 
 		 399 aa  797    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0850  amidohydrolase 3  80.81 
 
 		 402 aa  654    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4072  enamidase  88.01 
 
 		 401 aa  688    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.815996  normal  0.0735984 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4330  amidohydrolase  76.92 
 
 		 399 aa  617  1e-176  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0661  enamidase  77.18 
 
 		 422 aa  619  1e-176  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2433  enamidase  70.57 
 
 		 398 aa  558  1e-158  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.670519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4206  amidohydrolase  70.28 
 
 		 399 aa  560  1e-158  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1671  amidohydrolase  69.17 
 
 		 398 aa  550  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.446042  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2144  amidohydrolase  50.65 
 
 		 387 aa  374  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3945  amidohydrolase  41.91 
 
 		 385 aa  270  4e-71  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.464542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0577  amidohydrolase 3  38.97 
 
 		 392 aa  269  5.9999999999999995e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0623992  normal  0.192894 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0253  amidohydrolase 3  44.68 
 
 		 551 aa  48.1  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1054  amidohydrolase-like  43.42 
 
 		 576 aa  48.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.655132  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  34.69 
 
 		 382 aa  47.8  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  22.56 
 
 		 382 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2578  amidohydrolase  41.79 
 
 		 345 aa  46.6  0.0007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.786376  normal  0.942138 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3976  hypothetical protein  35.9 
 
 		 659 aa  46.6  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.156078  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  27.13 
 
 		 424 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  30.86 
 
 		 423 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2987  dihydroorotase  25.34 
 
 		 402 aa  45.1  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3252  N-ethylammeline chlorohydrolase  36.36 
 
 		 432 aa  45.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  29.5 
 
 		 423 aa  44.3  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1018  amidohydrolase-like  42.42 
 
 		 541 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.121748 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  31.86 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1148  N-ethylammeline chlorohydrolase  23.33 
 
 		 445 aa  43.9  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.356182 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  31.86 
 
 		 412 aa  43.9  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1966  hypothetical protein  42.42 
 
 		 612 aa  43.5  0.006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5594  hypothetical protein  39.44 
 
 		 625 aa  43.5  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567248  normal  0.326488 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0221  amidohydrolase 3  33.73 
 
 		 660 aa  43.1  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.891557 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  31.07 
 
 		 421 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3246  amidohydrolase 3  40.62 
 
 		 564 aa  42.7  0.01  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00403694 
 
 
-
 
NC_003296  RS03928  hydrolase transmembrane protein  22.47 
 
 		 476 aa  42.7  0.01  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0597256 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>