More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0328 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  100 
 
 
423 aa  877    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  50.72 
 
 
424 aa  394  1e-108  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  50 
 
 
424 aa  381  1e-104  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  45.26 
 
 
428 aa  372  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  48.8 
 
 
423 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  48.9 
 
 
423 aa  355  8.999999999999999e-97  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  48.9 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  48.9 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  48.9 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  48.9 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  48.9 
 
 
423 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  48.17 
 
 
423 aa  353  4e-96  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  48.08 
 
 
423 aa  352  5e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  47.71 
 
 
423 aa  351  1e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  47.71 
 
 
423 aa  350  2e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  46.23 
 
 
423 aa  342  5.999999999999999e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  44.36 
 
 
424 aa  336  3.9999999999999995e-91  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  45.62 
 
 
413 aa  334  2e-90  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  43.67 
 
 
414 aa  325  1e-87  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  44.33 
 
 
410 aa  317  3e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  41.59 
 
 
412 aa  316  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  41.59 
 
 
412 aa  316  4e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  43.83 
 
 
429 aa  304  1.0000000000000001e-81  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  43.1 
 
 
405 aa  305  1.0000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  42.06 
 
 
410 aa  299  7e-80  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  41.27 
 
 
427 aa  298  1e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  41.42 
 
 
408 aa  297  3e-79  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
411 aa  295  9e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  41.42 
 
 
408 aa  295  1e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  41.16 
 
 
408 aa  295  1e-78  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  39.44 
 
 
427 aa  293  4e-78  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  40.58 
 
 
410 aa  293  4e-78  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  40.9 
 
 
408 aa  293  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  41.26 
 
 
469 aa  292  9e-78  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  40.9 
 
 
408 aa  291  1e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  40.9 
 
 
408 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  40.9 
 
 
408 aa  290  3e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  40.9 
 
 
408 aa  290  3e-77  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  41.16 
 
 
406 aa  290  4e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
407 aa  287  2e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
407 aa  287  2.9999999999999996e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  38.05 
 
 
411 aa  286  5e-76  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
407 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  42.52 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  42.49 
 
 
401 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  40.73 
 
 
412 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  42.49 
 
 
401 aa  284  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  40.63 
 
 
408 aa  282  6.000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  42.13 
 
 
401 aa  282  9e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  42.23 
 
 
401 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  39.58 
 
 
408 aa  281  2e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  39.74 
 
 
414 aa  281  2e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  41.39 
 
 
421 aa  280  3e-74  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  40.57 
 
 
401 aa  280  4e-74  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  40.52 
 
 
414 aa  280  5e-74  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  40.81 
 
 
401 aa  279  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  40.49 
 
 
392 aa  277  2e-73  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  41.9 
 
 
407 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0655  imidazolonepropionase  35.97 
 
 
413 aa  276  4e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  40.68 
 
 
407 aa  276  4e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  36.43 
 
 
429 aa  276  6e-73  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  42.4 
 
 
391 aa  276  6e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  42.67 
 
 
421 aa  276  7e-73  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  41.88 
 
 
401 aa  275  1.0000000000000001e-72  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  40.31 
 
 
431 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  41.65 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  41.65 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  40.24 
 
 
392 aa  275  2.0000000000000002e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  41.91 
 
 
411 aa  273  3e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  41.13 
 
 
407 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  41.39 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  40.32 
 
 
425 aa  273  5.000000000000001e-72  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  39.02 
 
 
415 aa  273  5.000000000000001e-72  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  39.95 
 
 
401 aa  273  6e-72  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  41.91 
 
 
393 aa  273  6e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  41.15 
 
 
407 aa  272  7e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  42.19 
 
 
407 aa  272  9e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  40.87 
 
 
407 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  40.83 
 
 
389 aa  271  2e-71  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  39.31 
 
 
408 aa  270  2e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  40.21 
 
 
406 aa  271  2e-71  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  41.09 
 
 
403 aa  271  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  41.49 
 
 
415 aa  270  2.9999999999999997e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  41.34 
 
 
402 aa  270  2.9999999999999997e-71  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  40.1 
 
 
411 aa  269  7e-71  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  41.62 
 
 
421 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  42.13 
 
 
382 aa  268  2e-70  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  40.96 
 
 
411 aa  268  2e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  39.52 
 
 
416 aa  267  2.9999999999999995e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  39.95 
 
 
439 aa  267  2.9999999999999995e-70  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  40.05 
 
 
402 aa  266  5e-70  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  41.98 
 
 
403 aa  265  2e-69  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  39.89 
 
 
416 aa  264  2e-69  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  36.49 
 
 
418 aa  263  3e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  39.29 
 
 
402 aa  264  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  40.57 
 
 
426 aa  263  4e-69  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>