More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2997 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_2997  imidazolonepropionase  100 
 
 
401 aa  790    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3615  imidazolonepropionase  71.98 
 
 
389 aa  539  9.999999999999999e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.292522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1107  imidazolonepropionase  66.75 
 
 
392 aa  488  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.792195 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0250  imidazolonepropionase  63.66 
 
 
393 aa  484  1e-136  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.304312 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0997  imidazolonepropionase  67.01 
 
 
392 aa  485  1e-136  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.153198 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1781  imidazolonepropionase  64.45 
 
 
382 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.381762 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0966  imidazolonepropionase  62.4 
 
 
382 aa  474  1e-132  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0512874  normal  0.193869 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1839  imidazolonepropionase  63.41 
 
 
402 aa  454  1.0000000000000001e-126  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0558916 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0099  imidazolonepropionase  60.46 
 
 
469 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.776305 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1423  imidazolonepropionase  62.69 
 
 
391 aa  439  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.773109  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4385  imidazolonepropionase  63.09 
 
 
391 aa  441  9.999999999999999e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4450  imidazolonepropionase  63.45 
 
 
407 aa  434  1e-120  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.158405  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6262  imidazolonepropionase  64.69 
 
 
381 aa  429  1e-119  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_04430  imidazolonepropionase  57.63 
 
 
416 aa  418  1e-116  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.243464  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30700  imidazolonepropionase  56.28 
 
 
454 aa  400  9.999999999999999e-111  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1313  imidazolonepropionase  53.98 
 
 
400 aa  384  1e-105  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1356  imidazolonepropionase  53.58 
 
 
403 aa  362  8e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000132796 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_02280  imidazolonepropionase  54.34 
 
 
401 aa  352  5e-96  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  40.57 
 
 
423 aa  280  4e-74  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  39.59 
 
 
424 aa  260  3e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  37.4 
 
 
411 aa  256  6e-67  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  40.1 
 
 
427 aa  251  1e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  41.49 
 
 
408 aa  244  1.9999999999999999e-63  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  43.91 
 
 
424 aa  242  9e-63  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  39.55 
 
 
408 aa  241  1e-62  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  39.55 
 
 
408 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  39.05 
 
 
414 aa  241  2e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  39.55 
 
 
408 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  39.55 
 
 
410 aa  241  2e-62  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  39.8 
 
 
405 aa  238  1e-61  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  41.6 
 
 
401 aa  238  1e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  39.05 
 
 
408 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  39.05 
 
 
408 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  39.05 
 
 
408 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  34.64 
 
 
411 aa  237  3e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  39.05 
 
 
408 aa  237  3e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3836  imidazolonepropionase  41.91 
 
 
439 aa  236  6e-61  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.320819  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  35.97 
 
 
423 aa  236  6e-61  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  37.44 
 
 
410 aa  236  6e-61  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  39.39 
 
 
424 aa  234  1.0000000000000001e-60  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  34.77 
 
 
428 aa  235  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  39.05 
 
 
408 aa  233  4.0000000000000004e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  39.18 
 
 
408 aa  231  1e-59  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2360  imidazolonepropionase  42.58 
 
 
421 aa  232  1e-59  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0284206  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  39.69 
 
 
408 aa  229  6e-59  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2448  imidazolonepropionase  43.7 
 
 
421 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  38.58 
 
 
414 aa  227  2e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  39.15 
 
 
410 aa  228  2e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2316  imidazolonepropionase  43.07 
 
 
426 aa  227  4e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0516695  normal  0.0796073 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1291  imidazolonepropionase  33.33 
 
 
429 aa  226  6e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.563644  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  32.44 
 
 
412 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  32.44 
 
 
412 aa  225  8e-58  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  35.51 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  35.51 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  35.51 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  35.75 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  35.51 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  35.51 
 
 
423 aa  225  9e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  35.75 
 
 
423 aa  225  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  36.06 
 
 
423 aa  225  1e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  35.27 
 
 
423 aa  224  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1507  imidazolonepropionase  41.73 
 
 
421 aa  224  2e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.473117  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  40.26 
 
 
399 aa  223  4e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  35.27 
 
 
423 aa  223  6e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  37.82 
 
 
414 aa  223  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  34.28 
 
 
413 aa  221  9.999999999999999e-57  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  35.02 
 
 
423 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  37.43 
 
 
403 aa  221  1.9999999999999999e-56  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3904  imidazolonepropionase  39.28 
 
 
505 aa  221  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.588827  normal  0.187263 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  40.69 
 
 
400 aa  220  3e-56  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  38.67 
 
 
412 aa  217  2e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4105  imidazolonepropionase  43.38 
 
 
427 aa  214  9.999999999999999e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1659  imidazolonepropionase  39.3 
 
 
427 aa  213  3.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  36.34 
 
 
429 aa  212  9e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  39.69 
 
 
411 aa  211  1e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  39.58 
 
 
411 aa  212  1e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  41.93 
 
 
414 aa  211  2e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  41.55 
 
 
415 aa  211  2e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4272  imidazolonepropionase  34.62 
 
 
414 aa  209  6e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1634  imidazolonepropionase  37.34 
 
 
411 aa  207  4e-52  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.783639 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  38.6 
 
 
400 aa  207  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  38.52 
 
 
431 aa  206  4e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  39.58 
 
 
408 aa  206  6e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  35.19 
 
 
403 aa  205  1e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  39.84 
 
 
425 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  37.63 
 
 
406 aa  204  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  38.81 
 
 
411 aa  202  6e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  33.84 
 
 
418 aa  202  7e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  36.73 
 
 
401 aa  202  7e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
407 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
407 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
407 aa  202  8e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
407 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
407 aa  202  8e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  36.98 
 
 
420 aa  202  9e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  36.27 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  37.92 
 
 
407 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  38.4 
 
 
404 aa  202  9.999999999999999e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  39.23 
 
 
405 aa  202  9.999999999999999e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>