203 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_4272 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_4272  imidazolonepropionase  100 
 
 
414 aa  852    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09041  imidazolonepropionase  54.26 
 
 
411 aa  461  9.999999999999999e-129  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.11911  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4570  imidazolonepropionase  52.32 
 
 
411 aa  452  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.256792  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1283  imidazolonepropionase  36.69 
 
 
424 aa  292  7e-78  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2817  imidazolonepropionase  38.98 
 
 
423 aa  291  1e-77  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  39.37 
 
 
408 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  39.37 
 
 
408 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  39.37 
 
 
408 aa  286  5.999999999999999e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  39.9 
 
 
410 aa  285  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  39.37 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  39.16 
 
 
408 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
410 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
408 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
408 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2160  imidazolonepropionase  37.41 
 
 
424 aa  281  1e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0242  imidazolonepropionase  37.26 
 
 
428 aa  280  3e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.61005  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  39.84 
 
 
416 aa  278  2e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  38.85 
 
 
408 aa  277  3e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2355  imidazolonepropionase  37.35 
 
 
412 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2398  imidazolonepropionase  37.35 
 
 
412 aa  276  4e-73  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  39.25 
 
 
407 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  39.25 
 
 
407 aa  276  5e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  39.89 
 
 
407 aa  276  7e-73  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0655  imidazolonepropionase  36.78 
 
 
413 aa  275  8e-73  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  39.41 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  39.41 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  39.31 
 
 
408 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  39.35 
 
 
407 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  40.21 
 
 
407 aa  274  3e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  38.98 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  38.98 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  38.98 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  38.98 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  38.98 
 
 
407 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  39.08 
 
 
407 aa  272  1e-71  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  37.23 
 
 
415 aa  271  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  39.08 
 
 
407 aa  270  2e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  38.06 
 
 
408 aa  269  5.9999999999999995e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  38.24 
 
 
414 aa  269  8e-71  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  38.19 
 
 
425 aa  269  8e-71  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0047  imidazolonepropionase  37.2 
 
 
413 aa  268  8.999999999999999e-71  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  38.56 
 
 
414 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  37.98 
 
 
412 aa  266  4e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  37.7 
 
 
406 aa  266  5e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  37.86 
 
 
431 aa  265  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_002950  PG0328  imidazolonepropionase  36.25 
 
 
423 aa  264  2e-69  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.835664 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  38.66 
 
 
403 aa  265  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1595  imidazolonepropionase  38.1 
 
 
410 aa  263  3e-69  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  38.16 
 
 
407 aa  263  3e-69  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  39.43 
 
 
423 aa  263  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  38.56 
 
 
418 aa  262  6e-69  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  39.28 
 
 
401 aa  262  8e-69  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1049  imidazolonepropionase  36.54 
 
 
429 aa  261  1e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0280969  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  38.65 
 
 
407 aa  261  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0607  imidazolonepropionase  36.99 
 
 
427 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  39.48 
 
 
402 aa  261  2e-68  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4041  imidazolonepropionase  36.34 
 
 
405 aa  259  4e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  37.87 
 
 
411 aa  259  7e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  37.37 
 
 
431 aa  259  8e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  38.5 
 
 
399 aa  258  1e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3440  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
423 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3403  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
423 aa  257  2e-67  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3660  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
423 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3710  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
423 aa  257  2e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.11084  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3683  imidazolonepropionase  36.39 
 
 
423 aa  257  2e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0019435  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3758  imidazolonepropionase  36.14 
 
 
423 aa  256  4e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2310  imidazolonepropionase  36.93 
 
 
423 aa  256  4e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.299843  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3678  imidazolonepropionase  36.14 
 
 
423 aa  256  5e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.439583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3352  imidazolonepropionase  36.14 
 
 
423 aa  256  5e-67  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  36.48 
 
 
402 aa  255  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  37.6 
 
 
411 aa  254  1.0000000000000001e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1558  imidazolonepropionase  36.14 
 
 
423 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.240138  normal  0.0370079 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  39.18 
 
 
416 aa  254  2.0000000000000002e-66  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3337  imidazolonepropionase  35.9 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.310939  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  37.56 
 
 
401 aa  252  8.000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  36.53 
 
 
407 aa  252  1e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  38.5 
 
 
401 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  38.5 
 
 
401 aa  252  1e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  38.37 
 
 
406 aa  251  2e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  39.09 
 
 
402 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  38.5 
 
 
401 aa  250  4e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  38.37 
 
 
406 aa  250  4e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  39.22 
 
 
417 aa  249  5e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  37.31 
 
 
401 aa  248  1e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  38.86 
 
 
407 aa  248  1e-64  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  37.21 
 
 
401 aa  248  1e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  38.08 
 
 
406 aa  248  1e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  36.91 
 
 
456 aa  247  3e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  37.71 
 
 
416 aa  247  3e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  37.4 
 
 
404 aa  246  4.9999999999999997e-64  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  37.89 
 
 
402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  41.24 
 
 
410 aa  244  3e-63  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  38.9 
 
 
400 aa  243  3.9999999999999997e-63  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  35.12 
 
 
403 aa  241  1e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  39.65 
 
 
405 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2731  imidazolonepropionase  35.92 
 
 
411 aa  241  2e-62  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.626121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0585  imidazolonepropionase  36.09 
 
 
415 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0914  imidazolonepropionase  37.3 
 
 
414 aa  240  2.9999999999999997e-62  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2377  imidazolonepropionase  39.82 
 
 
424 aa  241  2.9999999999999997e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.887652  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>