250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_A2943 on replicon NC_007951
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006348  BMA0649  imidazolonepropionase  76.98 
 
 
407 aa  638    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2792  imidazolonepropionase  76.73 
 
 
407 aa  635    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5478  imidazolonepropionase  82.67 
 
 
407 aa  676    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.823405  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2943  imidazolonepropionase  100 
 
 
431 aa  880    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.74957 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5909  imidazolonepropionase  81.44 
 
 
407 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1534  imidazolonepropionase  97.05 
 
 
407 aa  808    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2207  imidazolonepropionase  82.18 
 
 
407 aa  671    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2185  imidazolonepropionase  81.68 
 
 
407 aa  669    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.721027  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2168  imidazolonepropionase  81.44 
 
 
407 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2362  imidazolonepropionase  76.98 
 
 
407 aa  638    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.443035  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2923  imidazolonepropionase  76.98 
 
 
407 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2663  imidazolonepropionase  76.98 
 
 
407 aa  637    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2719  imidazolonepropionase  76.98 
 
 
407 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1677  imidazolonepropionase  76.98 
 
 
407 aa  638    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1102  imidazolonepropionase  81.68 
 
 
407 aa  671    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.238791  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1810  imidazolonepropionase  88.09 
 
 
406 aa  718    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.35586  normal  0.577738 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2084  imidazolonepropionase  82.43 
 
 
407 aa  672    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.340363  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1824  imidazolonepropionase  77.23 
 
 
407 aa  613  9.999999999999999e-175  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2852  imidazolonepropionase  75.06 
 
 
415 aa  588  1e-167  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.579633  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2713  imidazolonepropionase  73.03 
 
 
423 aa  540  9.999999999999999e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.281626  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1035  imidazolonepropionase  62.59 
 
 
425 aa  509  1e-143  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.281228 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0164  imidazolonepropionase  63.64 
 
 
416 aa  501  1e-141  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0152  imidazolonepropionase  59.58 
 
 
431 aa  482  1e-135  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.280226 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0367  imidazolonepropionase  60.71 
 
 
401 aa  471  1e-132  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.753041 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67250  imidazolonepropionase  61 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.751738  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2878  imidazolonepropionase  61.93 
 
 
411 aa  465  9.999999999999999e-131  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0434  imidazolonepropionase  60.25 
 
 
401 aa  464  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.133712  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5030  imidazolonepropionase  59.5 
 
 
401 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5277  imidazolonepropionase  59.5 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4904  imidazolonepropionase  59.25 
 
 
401 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5080  imidazolonepropionase  59.25 
 
 
401 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.359513  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4835  imidazolonepropionase  59.75 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.246682  normal  0.775663 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3900  imidazolonepropionase  58.19 
 
 
406 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5826  imidazolonepropionase  59.6 
 
 
402 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2472  imidazolonepropionase  61.93 
 
 
411 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2961  imidazolonepropionase  63.66 
 
 
416 aa  456  1e-127  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.281832  normal  0.765672 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2222  imidazolonepropionase  59.85 
 
 
406 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.201457  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3955  imidazolonepropionase  58.27 
 
 
410 aa  448  1e-125  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2113  imidazolonepropionase  59.85 
 
 
406 aa  449  1e-125  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.669841  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2644  imidazolonepropionase  61.62 
 
 
408 aa  446  1.0000000000000001e-124  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.142165  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2512  imidazolonepropionase  59.59 
 
 
406 aa  446  1.0000000000000001e-124  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0955381 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0911  imidazolonepropionase  53.83 
 
 
418 aa  444  1e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.878232  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0766  imidazolonepropionase  57.85 
 
 
403 aa  442  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0095  imidazolonepropionase  56.48 
 
 
408 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1436  imidazolonepropionase  59.84 
 
 
405 aa  439  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0632671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0099  imidazolonepropionase  56.48 
 
 
410 aa  441  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0748  imidazolonepropionase  57.85 
 
 
403 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0081  imidazolonepropionase  55.15 
 
 
414 aa  438  9.999999999999999e-123  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0100  imidazolonepropionase  56.22 
 
 
408 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4254  imidazolonepropionase  56.48 
 
 
408 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2077  imidazolonepropionase  60.2 
 
 
407 aa  440  9.999999999999999e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.819933  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0095  imidazolonepropionase  56.74 
 
 
408 aa  437  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26160  imidazolonepropionase  59.34 
 
 
403 aa  437  1e-121  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.242908  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4171  imidazolonepropionase  55.73 
 
 
414 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4551  imidazolonepropionase  56.64 
 
 
402 aa  435  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0097  imidazolonepropionase  56.74 
 
 
408 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0092  imidazolonepropionase  56.74 
 
 
408 aa  436  1e-121  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0098  imidazolonepropionase  56.74 
 
 
408 aa  436  1e-121  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0080  imidazolonepropionase  56.51 
 
 
412 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0077  imidazolonepropionase  56.22 
 
 
408 aa  437  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4449  imidazolonepropionase  54.92 
 
 
408 aa  432  1e-120  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0929  imidazolonepropionase  56.68 
 
 
405 aa  431  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4633  imidazolonepropionase  58.57 
 
 
399 aa  430  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4840  imidazolonepropionase  54.92 
 
 
408 aa  430  1e-119  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1253  imidazolonepropionase  60.52 
 
 
404 aa  429  1e-119  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3759  imidazolonepropionase  55.44 
 
 
408 aa  430  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0456459 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1039  imidazolonepropionase  59.75 
 
 
400 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.017849  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003720  imidazolonepropionase  54.9 
 
 
416 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1303  imidazolonepropionase  62.63 
 
 
414 aa  424  1e-117  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2655  imidazolonepropionase  60.26 
 
 
403 aa  424  1e-117  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.693274  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1032  imidazolonepropionase  55.8 
 
 
403 aa  421  1e-116  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3648  imidazolonepropionase  55.27 
 
 
456 aa  421  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.305714  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0871  imidazolonepropionase  56.68 
 
 
405 aa  415  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1934  imidazolonepropionase  56.03 
 
 
445 aa  416  9.999999999999999e-116  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.754156  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0705  imidazolonepropionase  54.06 
 
 
407 aa  413  1e-114  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.254445  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6452  imidazolonepropionase  58.48 
 
 
404 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1298  imidazolonepropionase  60.75 
 
 
401 aa  415  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.167315 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4073  imidazolonepropionase  60.05 
 
 
405 aa  412  1e-114  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5926  imidazolonepropionase  54.46 
 
 
420 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.103117  normal  0.194871 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1654  imidazolonepropionase  65.12 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0408106  normal  0.0708418 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02075  imidazolonepropionase  57.02 
 
 
416 aa  407  1.0000000000000001e-112  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0710  imidazolonepropionase  59.32 
 
 
400 aa  405  1.0000000000000001e-112  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0244926  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1688  imidazolonepropionase  55.64 
 
 
403 aa  402  1e-111  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.823771  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2549  imidazolonepropionase  57.83 
 
 
407 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5959  imidazolonepropionase  56.41 
 
 
406 aa  401  9.999999999999999e-111  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.946699  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3004  imidazolonepropionase  59.25 
 
 
405 aa  396  1e-109  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.783832  normal  0.525072 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2986  imidazolonepropionase  54.27 
 
 
417 aa  398  1e-109  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0848  imidazolonepropionase  51.77 
 
 
446 aa  395  1e-108  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0633495 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0825  imidazolonepropionase  54.91 
 
 
402 aa  393  1e-108  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000174389  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6922  imidazolonepropionase  55.94 
 
 
420 aa  390  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.386795  normal  0.926184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0851  imidazolonepropionase  51.47 
 
 
420 aa  388  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0937  imidazolonepropionase  52.39 
 
 
407 aa  386  1e-106  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.91714 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0914  imidazolonepropionase  52.14 
 
 
407 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106012  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0823  imidazolonepropionase  52.39 
 
 
407 aa  384  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.641221  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0882  imidazolonepropionase  52.39 
 
 
407 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03129  imidazolonepropionase  55.39 
 
 
419 aa  381  1e-104  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1260  imidazolonepropionase  50.87 
 
 
418 aa  379  1e-104  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00726  imidazolonepropionase  58.51 
 
 
401 aa  377  1e-103  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.15729  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1578  imidazolonepropionase  55.42 
 
 
410 aa  375  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0729988  normal  0.0660872 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2934  imidazolonepropionase  56.15 
 
 
395 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.277878  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>